Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY35

CLDND1, Claudin domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 253 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDND1Q9NY35 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDND1Q9NY35 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
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