Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ASF1BQ9NVP2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms