Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FOXD4L1Q9NU39 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FOXD4L1Q9NU39 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FOXD4L1Q9NU39 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FOXD4L1Q9NU39 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FOXD4L1Q9NU39 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FOXD4L1Q9NU39 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FOXD4L1Q9NU39 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FOXD4L1Q9NU39 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FOXD4L1Q9NU39 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FOXD4L1Q9NU39 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FOXD4L1Q9NU39 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FOXD4L1Q9NU39 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FOXD4L1Q9NU39 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
FOXD4L1Q9NU39 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FOXD4L1Q9NU39 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
FOXD4L1Q9NU39 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FOXD4L1Q9NU39 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FOXD4L1Q9NU39 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FOXD4L1Q9NU39 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FOXD4L1Q9NU39 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FOXD4L1Q9NU39 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FOXD4L1Q9NU39 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FOXD4L1Q9NU39 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FOXD4L1Q9NU39 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FOXD4L1Q9NU39 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FOXD4L1Q9NU39 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FOXD4L1Q9NU39 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FOXD4L1Q9NU39 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FOXD4L1Q9NU39 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FOXD4L1Q9NU39 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FOXD4L1Q9NU39 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FOXD4L1Q9NU39 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FOXD4L1Q9NU39 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FOXD4L1Q9NU39 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FOXD4L1Q9NU39 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FOXD4L1Q9NU39 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FOXD4L1Q9NU39 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FOXD4L1Q9NU39 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FOXD4L1Q9NU39 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FOXD4L1Q9NU39 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FOXD4L1Q9NU39 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FOXD4L1Q9NU39 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FOXD4L1Q9NU39 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FOXD4L1Q9NU39 OR2J1-201ENST00000377171 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FOXD4L1Q9NU39 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
FOXD4L1Q9NU39 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FOXD4L1Q9NU39 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FOXD4L1Q9NU39 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FOXD4L1Q9NU39 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FOXD4L1Q9NU39 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FOXD4L1Q9NU39 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FOXD4L1Q9NU39 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FOXD4L1Q9NU39 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FOXD4L1Q9NU39 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FOXD4L1Q9NU39 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FOXD4L1Q9NU39 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOXD4L1Q9NU39 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOXD4L1Q9NU39 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOXD4L1Q9NU39 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
FOXD4L1Q9NU39 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOXD4L1Q9NU39 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOXD4L1Q9NU39 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOXD4L1Q9NU39 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOXD4L1Q9NU39 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOXD4L1Q9NU39 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOXD4L1Q9NU39 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
FOXD4L1Q9NU39 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOXD4L1Q9NU39 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOXD4L1Q9NU39 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOXD4L1Q9NU39 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOXD4L1Q9NU39 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOXD4L1Q9NU39 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOXD4L1Q9NU39 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
FOXD4L1Q9NU39 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOXD4L1Q9NU39 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXD4L1Q9NU39 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms