Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
TM7SF3Q9NS93 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TM7SF3Q9NS93 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms