Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRU3

CNNM1, Metal transporter CNNM1, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM1Q9NRU3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNNM1Q9NRU3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNNM1Q9NRU3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNNM1Q9NRU3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CNNM1Q9NRU3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNNM1Q9NRU3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CNNM1Q9NRU3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNNM1Q9NRU3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNNM1Q9NRU3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNNM1Q9NRU3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNNM1Q9NRU3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNNM1Q9NRU3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNNM1Q9NRU3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNNM1Q9NRU3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNNM1Q9NRU3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNNM1Q9NRU3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNNM1Q9NRU3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNNM1Q9NRU3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNNM1Q9NRU3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNNM1Q9NRU3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNNM1Q9NRU3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNNM1Q9NRU3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNNM1Q9NRU3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNNM1Q9NRU3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNNM1Q9NRU3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNNM1Q9NRU3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNNM1Q9NRU3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CNNM1Q9NRU3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CNNM1Q9NRU3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CNNM1Q9NRU3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNNM1Q9NRU3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNNM1Q9NRU3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNNM1Q9NRU3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNNM1Q9NRU3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNNM1Q9NRU3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNNM1Q9NRU3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNNM1Q9NRU3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNNM1Q9NRU3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNNM1Q9NRU3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNNM1Q9NRU3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNNM1Q9NRU3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNNM1Q9NRU3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNNM1Q9NRU3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNNM1Q9NRU3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNNM1Q9NRU3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNNM1Q9NRU3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNNM1Q9NRU3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNNM1Q9NRU3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNNM1Q9NRU3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNNM1Q9NRU3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNNM1Q9NRU3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CNNM1Q9NRU3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNNM1Q9NRU3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNNM1Q9NRU3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNNM1Q9NRU3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNNM1Q9NRU3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNNM1Q9NRU3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNNM1Q9NRU3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNNM1Q9NRU3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNNM1Q9NRU3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNNM1Q9NRU3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNNM1Q9NRU3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNNM1Q9NRU3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CNNM1Q9NRU3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNNM1Q9NRU3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNNM1Q9NRU3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNNM1Q9NRU3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CNNM1Q9NRU3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNNM1Q9NRU3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNNM1Q9NRU3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNNM1Q9NRU3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNNM1Q9NRU3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNNM1Q9NRU3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNNM1Q9NRU3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNNM1Q9NRU3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNNM1Q9NRU3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNNM1Q9NRU3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNNM1Q9NRU3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNNM1Q9NRU3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNNM1Q9NRU3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNNM1Q9NRU3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNNM1Q9NRU3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CNNM1Q9NRU3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNNM1Q9NRU3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNNM1Q9NRU3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNNM1Q9NRU3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNNM1Q9NRU3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CNNM1Q9NRU3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNNM1Q9NRU3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNNM1Q9NRU3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNNM1Q9NRU3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNNM1Q9NRU3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNNM1Q9NRU3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNNM1Q9NRU3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNNM1Q9NRU3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNNM1Q9NRU3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNNM1Q9NRU3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNNM1Q9NRU3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNNM1Q9NRU3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNNM1Q9NRU3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms