Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD9

DUOX1, Dual oxidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX1Q9NRD9 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DUOX1Q9NRD9 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DUOX1Q9NRD9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DUOX1Q9NRD9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DUOX1Q9NRD9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DUOX1Q9NRD9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DUOX1Q9NRD9 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DUOX1Q9NRD9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DUOX1Q9NRD9 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DUOX1Q9NRD9 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DUOX1Q9NRD9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DUOX1Q9NRD9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DUOX1Q9NRD9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
DUOX1Q9NRD9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DUOX1Q9NRD9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DUOX1Q9NRD9 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DUOX1Q9NRD9 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
DUOX1Q9NRD9 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DUOX1Q9NRD9 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DUOX1Q9NRD9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DUOX1Q9NRD9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DUOX1Q9NRD9 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DUOX1Q9NRD9 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DUOX1Q9NRD9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DUOX1Q9NRD9 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DUOX1Q9NRD9 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DUOX1Q9NRD9 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DUOX1Q9NRD9 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DUOX1Q9NRD9 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DUOX1Q9NRD9 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DUOX1Q9NRD9 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DUOX1Q9NRD9 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DUOX1Q9NRD9 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
DUOX1Q9NRD9 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DUOX1Q9NRD9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DUOX1Q9NRD9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DUOX1Q9NRD9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DUOX1Q9NRD9 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DUOX1Q9NRD9 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DUOX1Q9NRD9 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DUOX1Q9NRD9 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DUOX1Q9NRD9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DUOX1Q9NRD9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DUOX1Q9NRD9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DUOX1Q9NRD9 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DUOX1Q9NRD9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DUOX1Q9NRD9 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DUOX1Q9NRD9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DUOX1Q9NRD9 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DUOX1Q9NRD9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DUOX1Q9NRD9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DUOX1Q9NRD9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DUOX1Q9NRD9 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DUOX1Q9NRD9 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DUOX1Q9NRD9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DUOX1Q9NRD9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DUOX1Q9NRD9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DUOX1Q9NRD9 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DUOX1Q9NRD9 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DUOX1Q9NRD9 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DUOX1Q9NRD9 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DUOX1Q9NRD9 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
DUOX1Q9NRD9 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DUOX1Q9NRD9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
DUOX1Q9NRD9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
DUOX1Q9NRD9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DUOX1Q9NRD9 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DUOX1Q9NRD9 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DUOX1Q9NRD9 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DUOX1Q9NRD9 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DUOX1Q9NRD9 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DUOX1Q9NRD9 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DUOX1Q9NRD9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DUOX1Q9NRD9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DUOX1Q9NRD9 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DUOX1Q9NRD9 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DUOX1Q9NRD9 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DUOX1Q9NRD9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DUOX1Q9NRD9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DUOX1Q9NRD9 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
DUOX1Q9NRD9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DUOX1Q9NRD9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DUOX1Q9NRD9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DUOX1Q9NRD9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DUOX1Q9NRD9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DUOX1Q9NRD9 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DUOX1Q9NRD9 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DUOX1Q9NRD9 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DUOX1Q9NRD9 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DUOX1Q9NRD9 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DUOX1Q9NRD9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DUOX1Q9NRD9 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DUOX1Q9NRD9 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DUOX1Q9NRD9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DUOX1Q9NRD9 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DUOX1Q9NRD9 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DUOX1Q9NRD9 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
DUOX1Q9NRD9 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
DUOX1Q9NRD9 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DUOX1Q9NRD9 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms