Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS7

INCENP, Inner centromere protein, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INCENPQ9NQS7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
INCENPQ9NQS7 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
INCENPQ9NQS7 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
INCENPQ9NQS7 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
INCENPQ9NQS7 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
INCENPQ9NQS7 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
INCENPQ9NQS7 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
INCENPQ9NQS7 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
INCENPQ9NQS7 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
INCENPQ9NQS7 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
INCENPQ9NQS7 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
INCENPQ9NQS7 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
INCENPQ9NQS7 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
INCENPQ9NQS7 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
INCENPQ9NQS7 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
INCENPQ9NQS7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
INCENPQ9NQS7 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
INCENPQ9NQS7 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
INCENPQ9NQS7 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
INCENPQ9NQS7 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
INCENPQ9NQS7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
INCENPQ9NQS7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
INCENPQ9NQS7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
INCENPQ9NQS7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
INCENPQ9NQS7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
INCENPQ9NQS7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
INCENPQ9NQS7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
INCENPQ9NQS7 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
INCENPQ9NQS7 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
INCENPQ9NQS7 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
INCENPQ9NQS7 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
INCENPQ9NQS7 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
INCENPQ9NQS7 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
INCENPQ9NQS7 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
INCENPQ9NQS7 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
INCENPQ9NQS7 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
INCENPQ9NQS7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
INCENPQ9NQS7 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
INCENPQ9NQS7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
INCENPQ9NQS7 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
INCENPQ9NQS7 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
INCENPQ9NQS7 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
INCENPQ9NQS7 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
INCENPQ9NQS7 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
INCENPQ9NQS7 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
INCENPQ9NQS7 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
INCENPQ9NQS7 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
INCENPQ9NQS7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
INCENPQ9NQS7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
INCENPQ9NQS7 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
INCENPQ9NQS7 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
INCENPQ9NQS7 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
INCENPQ9NQS7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
INCENPQ9NQS7 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
INCENPQ9NQS7 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
INCENPQ9NQS7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
INCENPQ9NQS7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
INCENPQ9NQS7 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
INCENPQ9NQS7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
INCENPQ9NQS7 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
INCENPQ9NQS7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
INCENPQ9NQS7 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
INCENPQ9NQS7 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
INCENPQ9NQS7 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
INCENPQ9NQS7 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
INCENPQ9NQS7 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
INCENPQ9NQS7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
INCENPQ9NQS7 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
INCENPQ9NQS7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
INCENPQ9NQS7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
INCENPQ9NQS7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
INCENPQ9NQS7 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
INCENPQ9NQS7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
INCENPQ9NQS7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
INCENPQ9NQS7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
INCENPQ9NQS7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
INCENPQ9NQS7 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
INCENPQ9NQS7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
INCENPQ9NQS7 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
INCENPQ9NQS7 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
INCENPQ9NQS7 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
INCENPQ9NQS7 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
INCENPQ9NQS7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
INCENPQ9NQS7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
INCENPQ9NQS7 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
INCENPQ9NQS7 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
INCENPQ9NQS7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
INCENPQ9NQS7 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
INCENPQ9NQS7 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
INCENPQ9NQS7 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
INCENPQ9NQS7 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
INCENPQ9NQS7 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
INCENPQ9NQS7 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
INCENPQ9NQS7 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
INCENPQ9NQS7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
INCENPQ9NQS7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
INCENPQ9NQS7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
INCENPQ9NQS7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
INCENPQ9NQS7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
INCENPQ9NQS7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms