Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQH7

XPNPEP3, Probable Xaa-Pro aminopeptidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPNPEP3Q9NQH7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
XPNPEP3Q9NQH7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
XPNPEP3Q9NQH7 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
XPNPEP3Q9NQH7 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
XPNPEP3Q9NQH7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
XPNPEP3Q9NQH7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
XPNPEP3Q9NQH7 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
XPNPEP3Q9NQH7 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
XPNPEP3Q9NQH7 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
XPNPEP3Q9NQH7 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
XPNPEP3Q9NQH7 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
XPNPEP3Q9NQH7 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
XPNPEP3Q9NQH7 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
XPNPEP3Q9NQH7 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
XPNPEP3Q9NQH7 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
XPNPEP3Q9NQH7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
XPNPEP3Q9NQH7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
XPNPEP3Q9NQH7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
XPNPEP3Q9NQH7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
XPNPEP3Q9NQH7 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
XPNPEP3Q9NQH7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
XPNPEP3Q9NQH7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
XPNPEP3Q9NQH7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
XPNPEP3Q9NQH7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
XPNPEP3Q9NQH7 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
XPNPEP3Q9NQH7 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
XPNPEP3Q9NQH7 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
XPNPEP3Q9NQH7 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
XPNPEP3Q9NQH7 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
XPNPEP3Q9NQH7 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
XPNPEP3Q9NQH7 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
XPNPEP3Q9NQH7 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
XPNPEP3Q9NQH7 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
XPNPEP3Q9NQH7 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
XPNPEP3Q9NQH7 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
XPNPEP3Q9NQH7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
XPNPEP3Q9NQH7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
XPNPEP3Q9NQH7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
XPNPEP3Q9NQH7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
XPNPEP3Q9NQH7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
XPNPEP3Q9NQH7 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
XPNPEP3Q9NQH7 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
XPNPEP3Q9NQH7 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
XPNPEP3Q9NQH7 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
XPNPEP3Q9NQH7 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
XPNPEP3Q9NQH7 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
XPNPEP3Q9NQH7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
XPNPEP3Q9NQH7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
XPNPEP3Q9NQH7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
XPNPEP3Q9NQH7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
XPNPEP3Q9NQH7 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
XPNPEP3Q9NQH7 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
XPNPEP3Q9NQH7 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
XPNPEP3Q9NQH7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
XPNPEP3Q9NQH7 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
XPNPEP3Q9NQH7 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
XPNPEP3Q9NQH7 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
XPNPEP3Q9NQH7 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
XPNPEP3Q9NQH7 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
XPNPEP3Q9NQH7 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
XPNPEP3Q9NQH7 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
XPNPEP3Q9NQH7 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
XPNPEP3Q9NQH7 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
XPNPEP3Q9NQH7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
XPNPEP3Q9NQH7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
XPNPEP3Q9NQH7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
XPNPEP3Q9NQH7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
XPNPEP3Q9NQH7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
XPNPEP3Q9NQH7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
XPNPEP3Q9NQH7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
XPNPEP3Q9NQH7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
XPNPEP3Q9NQH7 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
XPNPEP3Q9NQH7 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
XPNPEP3Q9NQH7 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
XPNPEP3Q9NQH7 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
XPNPEP3Q9NQH7 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
XPNPEP3Q9NQH7 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
XPNPEP3Q9NQH7 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
XPNPEP3Q9NQH7 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
XPNPEP3Q9NQH7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms