Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPP4

NLRC4, NLR family CARD domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC4Q9NPP4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRC4Q9NPP4 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLRC4Q9NPP4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLRC4Q9NPP4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLRC4Q9NPP4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms