Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPJ6

MED4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED4Q9NPJ6 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MED4Q9NPJ6 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MED4Q9NPJ6 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MED4Q9NPJ6 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MED4Q9NPJ6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MED4Q9NPJ6 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MED4Q9NPJ6 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MED4Q9NPJ6 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MED4Q9NPJ6 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MED4Q9NPJ6 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MED4Q9NPJ6 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MED4Q9NPJ6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MED4Q9NPJ6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MED4Q9NPJ6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MED4Q9NPJ6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MED4Q9NPJ6 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MED4Q9NPJ6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MED4Q9NPJ6 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MED4Q9NPJ6 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MED4Q9NPJ6 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MED4Q9NPJ6 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MED4Q9NPJ6 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MED4Q9NPJ6 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MED4Q9NPJ6 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MED4Q9NPJ6 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MED4Q9NPJ6 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MED4Q9NPJ6 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MED4Q9NPJ6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MED4Q9NPJ6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MED4Q9NPJ6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MED4Q9NPJ6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MED4Q9NPJ6 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MED4Q9NPJ6 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MED4Q9NPJ6 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MED4Q9NPJ6 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MED4Q9NPJ6 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MED4Q9NPJ6 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MED4Q9NPJ6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MED4Q9NPJ6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MED4Q9NPJ6 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MED4Q9NPJ6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MED4Q9NPJ6 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED4Q9NPJ6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED4Q9NPJ6 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED4Q9NPJ6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED4Q9NPJ6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED4Q9NPJ6 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED4Q9NPJ6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED4Q9NPJ6 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED4Q9NPJ6 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED4Q9NPJ6 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED4Q9NPJ6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED4Q9NPJ6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED4Q9NPJ6 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED4Q9NPJ6 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED4Q9NPJ6 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED4Q9NPJ6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED4Q9NPJ6 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED4Q9NPJ6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED4Q9NPJ6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED4Q9NPJ6 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED4Q9NPJ6 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED4Q9NPJ6 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED4Q9NPJ6 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED4Q9NPJ6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED4Q9NPJ6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED4Q9NPJ6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED4Q9NPJ6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED4Q9NPJ6 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED4Q9NPJ6 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED4Q9NPJ6 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED4Q9NPJ6 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED4Q9NPJ6 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MED4Q9NPJ6 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MED4Q9NPJ6 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MED4Q9NPJ6 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MED4Q9NPJ6 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MED4Q9NPJ6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MED4Q9NPJ6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MED4Q9NPJ6 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MED4Q9NPJ6 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MED4Q9NPJ6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MED4Q9NPJ6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MED4Q9NPJ6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MED4Q9NPJ6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MED4Q9NPJ6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MED4Q9NPJ6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MED4Q9NPJ6 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MED4Q9NPJ6 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MED4Q9NPJ6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MED4Q9NPJ6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
MED4Q9NPJ6 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
MED4Q9NPJ6 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
MED4Q9NPJ6 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MED4Q9NPJ6 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MED4Q9NPJ6 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MED4Q9NPJ6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MED4Q9NPJ6 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MED4Q9NPJ6 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MED4Q9NPJ6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms