Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

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Length 1,115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRHQ9HD43 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRHQ9HD43 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRHQ9HD43 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRHQ9HD43 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRHQ9HD43 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRHQ9HD43 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRHQ9HD43 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRHQ9HD43 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PTPRHQ9HD43 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PTPRHQ9HD43 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRHQ9HD43 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRHQ9HD43 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRHQ9HD43 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRHQ9HD43 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRHQ9HD43 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRHQ9HD43 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRHQ9HD43 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRHQ9HD43 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRHQ9HD43 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRHQ9HD43 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRHQ9HD43 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRHQ9HD43 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRHQ9HD43 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRHQ9HD43 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRHQ9HD43 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRHQ9HD43 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRHQ9HD43 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRHQ9HD43 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRHQ9HD43 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRHQ9HD43 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRHQ9HD43 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRHQ9HD43 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRHQ9HD43 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRHQ9HD43 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRHQ9HD43 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRHQ9HD43 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRHQ9HD43 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRHQ9HD43 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRHQ9HD43 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRHQ9HD43 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRHQ9HD43 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRHQ9HD43 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRHQ9HD43 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRHQ9HD43 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRHQ9HD43 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRHQ9HD43 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRHQ9HD43 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRHQ9HD43 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRHQ9HD43 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRHQ9HD43 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRHQ9HD43 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRHQ9HD43 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRHQ9HD43 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRHQ9HD43 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRHQ9HD43 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRHQ9HD43 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRHQ9HD43 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRHQ9HD43 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRHQ9HD43 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRHQ9HD43 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRHQ9HD43 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRHQ9HD43 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRHQ9HD43 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRHQ9HD43 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRHQ9HD43 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRHQ9HD43 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRHQ9HD43 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRHQ9HD43 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRHQ9HD43 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRHQ9HD43 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRHQ9HD43 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRHQ9HD43 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRHQ9HD43 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRHQ9HD43 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRHQ9HD43 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRHQ9HD43 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRHQ9HD43 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRHQ9HD43 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRHQ9HD43 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRHQ9HD43 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRHQ9HD43 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRHQ9HD43 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRHQ9HD43 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRHQ9HD43 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRHQ9HD43 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRHQ9HD43 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRHQ9HD43 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRHQ9HD43 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRHQ9HD43 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRHQ9HD43 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRHQ9HD43 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRHQ9HD43 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRHQ9HD43 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRHQ9HD43 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRHQ9HD43 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRHQ9HD43 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRHQ9HD43 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRHQ9HD43 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRHQ9HD43 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
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