Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBW1

LRRC4, Leucine-rich repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4Q9HBW1 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC4Q9HBW1 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC4Q9HBW1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC4Q9HBW1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC4Q9HBW1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC4Q9HBW1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC4Q9HBW1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC4Q9HBW1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC4Q9HBW1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC4Q9HBW1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC4Q9HBW1 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC4Q9HBW1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC4Q9HBW1 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC4Q9HBW1 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC4Q9HBW1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC4Q9HBW1 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC4Q9HBW1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC4Q9HBW1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC4Q9HBW1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC4Q9HBW1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC4Q9HBW1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC4Q9HBW1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC4Q9HBW1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC4Q9HBW1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC4Q9HBW1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC4Q9HBW1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC4Q9HBW1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC4Q9HBW1 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC4Q9HBW1 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC4Q9HBW1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC4Q9HBW1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC4Q9HBW1 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC4Q9HBW1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC4Q9HBW1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC4Q9HBW1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC4Q9HBW1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC4Q9HBW1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC4Q9HBW1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC4Q9HBW1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC4Q9HBW1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC4Q9HBW1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC4Q9HBW1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC4Q9HBW1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC4Q9HBW1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC4Q9HBW1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC4Q9HBW1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC4Q9HBW1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC4Q9HBW1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC4Q9HBW1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC4Q9HBW1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC4Q9HBW1 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC4Q9HBW1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC4Q9HBW1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC4Q9HBW1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC4Q9HBW1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC4Q9HBW1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC4Q9HBW1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC4Q9HBW1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC4Q9HBW1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC4Q9HBW1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC4Q9HBW1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC4Q9HBW1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC4Q9HBW1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC4Q9HBW1 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC4Q9HBW1 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC4Q9HBW1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC4Q9HBW1 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC4Q9HBW1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC4Q9HBW1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC4Q9HBW1 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC4Q9HBW1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC4Q9HBW1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC4Q9HBW1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC4Q9HBW1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC4Q9HBW1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC4Q9HBW1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC4Q9HBW1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC4Q9HBW1 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC4Q9HBW1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC4Q9HBW1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC4Q9HBW1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC4Q9HBW1 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC4Q9HBW1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC4Q9HBW1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC4Q9HBW1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC4Q9HBW1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC4Q9HBW1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC4Q9HBW1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC4Q9HBW1 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC4Q9HBW1 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC4Q9HBW1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
LRRC4Q9HBW1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC4Q9HBW1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC4Q9HBW1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC4Q9HBW1 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC4Q9HBW1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC4Q9HBW1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC4Q9HBW1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC4Q9HBW1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC4Q9HBW1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms