Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB3

SLC52A2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A2Q9HAB3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC52A2Q9HAB3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC52A2Q9HAB3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC52A2Q9HAB3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC52A2Q9HAB3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC52A2Q9HAB3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC52A2Q9HAB3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC52A2Q9HAB3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC52A2Q9HAB3 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC52A2Q9HAB3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC52A2Q9HAB3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC52A2Q9HAB3 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC52A2Q9HAB3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC52A2Q9HAB3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC52A2Q9HAB3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC52A2Q9HAB3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC52A2Q9HAB3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC52A2Q9HAB3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC52A2Q9HAB3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC52A2Q9HAB3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC52A2Q9HAB3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC52A2Q9HAB3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC52A2Q9HAB3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC52A2Q9HAB3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC52A2Q9HAB3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC52A2Q9HAB3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC52A2Q9HAB3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC52A2Q9HAB3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC52A2Q9HAB3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC52A2Q9HAB3 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC52A2Q9HAB3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC52A2Q9HAB3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC52A2Q9HAB3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC52A2Q9HAB3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLC52A2Q9HAB3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SLC52A2Q9HAB3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLC52A2Q9HAB3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLC52A2Q9HAB3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLC52A2Q9HAB3 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SLC52A2Q9HAB3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLC52A2Q9HAB3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLC52A2Q9HAB3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC52A2Q9HAB3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC52A2Q9HAB3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC52A2Q9HAB3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC52A2Q9HAB3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC52A2Q9HAB3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC52A2Q9HAB3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC52A2Q9HAB3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC52A2Q9HAB3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC52A2Q9HAB3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC52A2Q9HAB3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC52A2Q9HAB3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC52A2Q9HAB3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC52A2Q9HAB3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC52A2Q9HAB3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC52A2Q9HAB3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC52A2Q9HAB3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC52A2Q9HAB3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC52A2Q9HAB3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC52A2Q9HAB3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC52A2Q9HAB3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC52A2Q9HAB3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC52A2Q9HAB3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC52A2Q9HAB3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC52A2Q9HAB3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC52A2Q9HAB3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC52A2Q9HAB3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC52A2Q9HAB3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC52A2Q9HAB3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC52A2Q9HAB3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC52A2Q9HAB3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC52A2Q9HAB3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC52A2Q9HAB3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC52A2Q9HAB3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC52A2Q9HAB3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC52A2Q9HAB3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC52A2Q9HAB3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC52A2Q9HAB3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC52A2Q9HAB3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC52A2Q9HAB3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC52A2Q9HAB3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC52A2Q9HAB3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC52A2Q9HAB3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC52A2Q9HAB3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC52A2Q9HAB3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC52A2Q9HAB3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC52A2Q9HAB3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC52A2Q9HAB3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC52A2Q9HAB3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC52A2Q9HAB3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC52A2Q9HAB3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC52A2Q9HAB3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC52A2Q9HAB3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC52A2Q9HAB3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC52A2Q9HAB3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC52A2Q9HAB3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC52A2Q9HAB3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC52A2Q9HAB3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SLC52A2Q9HAB3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms