Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9K5

ERVMER34-1, Endogenous retrovirus group MER34 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVMER34-1Q9H9K5 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVMER34-1Q9H9K5 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVMER34-1Q9H9K5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVMER34-1Q9H9K5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVMER34-1Q9H9K5 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVMER34-1Q9H9K5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVMER34-1Q9H9K5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVMER34-1Q9H9K5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVMER34-1Q9H9K5 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVMER34-1Q9H9K5 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVMER34-1Q9H9K5 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVMER34-1Q9H9K5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVMER34-1Q9H9K5 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVMER34-1Q9H9K5 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVMER34-1Q9H9K5 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVMER34-1Q9H9K5 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVMER34-1Q9H9K5 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVMER34-1Q9H9K5 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVMER34-1Q9H9K5 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVMER34-1Q9H9K5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVMER34-1Q9H9K5 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVMER34-1Q9H9K5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVMER34-1Q9H9K5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVMER34-1Q9H9K5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVMER34-1Q9H9K5 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVMER34-1Q9H9K5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVMER34-1Q9H9K5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVMER34-1Q9H9K5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVMER34-1Q9H9K5 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVMER34-1Q9H9K5 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVMER34-1Q9H9K5 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVMER34-1Q9H9K5 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVMER34-1Q9H9K5 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVMER34-1Q9H9K5 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVMER34-1Q9H9K5 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVMER34-1Q9H9K5 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVMER34-1Q9H9K5 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVMER34-1Q9H9K5 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVMER34-1Q9H9K5 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVMER34-1Q9H9K5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVMER34-1Q9H9K5 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVMER34-1Q9H9K5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVMER34-1Q9H9K5 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVMER34-1Q9H9K5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVMER34-1Q9H9K5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVMER34-1Q9H9K5 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVMER34-1Q9H9K5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVMER34-1Q9H9K5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVMER34-1Q9H9K5 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVMER34-1Q9H9K5 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVMER34-1Q9H9K5 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVMER34-1Q9H9K5 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVMER34-1Q9H9K5 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVMER34-1Q9H9K5 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVMER34-1Q9H9K5 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVMER34-1Q9H9K5 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVMER34-1Q9H9K5 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVMER34-1Q9H9K5 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVMER34-1Q9H9K5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVMER34-1Q9H9K5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVMER34-1Q9H9K5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVMER34-1Q9H9K5 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVMER34-1Q9H9K5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVMER34-1Q9H9K5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVMER34-1Q9H9K5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVMER34-1Q9H9K5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVMER34-1Q9H9K5 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVMER34-1Q9H9K5 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVMER34-1Q9H9K5 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVMER34-1Q9H9K5 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVMER34-1Q9H9K5 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVMER34-1Q9H9K5 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVMER34-1Q9H9K5 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVMER34-1Q9H9K5 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVMER34-1Q9H9K5 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVMER34-1Q9H9K5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVMER34-1Q9H9K5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVMER34-1Q9H9K5 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVMER34-1Q9H9K5 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVMER34-1Q9H9K5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVMER34-1Q9H9K5 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVMER34-1Q9H9K5 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVMER34-1Q9H9K5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVMER34-1Q9H9K5 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVMER34-1Q9H9K5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVMER34-1Q9H9K5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVMER34-1Q9H9K5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVMER34-1Q9H9K5 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVMER34-1Q9H9K5 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVMER34-1Q9H9K5 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVMER34-1Q9H9K5 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVMER34-1Q9H9K5 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVMER34-1Q9H9K5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVMER34-1Q9H9K5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVMER34-1Q9H9K5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVMER34-1Q9H9K5 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVMER34-1Q9H9K5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVMER34-1Q9H9K5 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVMER34-1Q9H9K5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVMER34-1Q9H9K5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms