Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E2

TDRD3, Tudor domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD3Q9H7E2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TDRD3Q9H7E2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TDRD3Q9H7E2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TDRD3Q9H7E2 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TDRD3Q9H7E2 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TDRD3Q9H7E2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TDRD3Q9H7E2 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TDRD3Q9H7E2 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TDRD3Q9H7E2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TDRD3Q9H7E2 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TDRD3Q9H7E2 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TDRD3Q9H7E2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TDRD3Q9H7E2 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TDRD3Q9H7E2 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TDRD3Q9H7E2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TDRD3Q9H7E2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TDRD3Q9H7E2 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TDRD3Q9H7E2 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TDRD3Q9H7E2 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TDRD3Q9H7E2 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TDRD3Q9H7E2 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TDRD3Q9H7E2 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TDRD3Q9H7E2 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TDRD3Q9H7E2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TDRD3Q9H7E2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TDRD3Q9H7E2 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TDRD3Q9H7E2 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TDRD3Q9H7E2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TDRD3Q9H7E2 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TDRD3Q9H7E2 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TDRD3Q9H7E2 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms