Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C11orf49Q9H6J7 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C11orf49Q9H6J7 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C11orf49Q9H6J7 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C11orf49Q9H6J7 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C11orf49Q9H6J7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C11orf49Q9H6J7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C11orf49Q9H6J7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C11orf49Q9H6J7 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C11orf49Q9H6J7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C11orf49Q9H6J7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C11orf49Q9H6J7 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C11orf49Q9H6J7 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C11orf49Q9H6J7 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C11orf49Q9H6J7 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C11orf49Q9H6J7 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C11orf49Q9H6J7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C11orf49Q9H6J7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C11orf49Q9H6J7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C11orf49Q9H6J7 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C11orf49Q9H6J7 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C11orf49Q9H6J7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C11orf49Q9H6J7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C11orf49Q9H6J7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C11orf49Q9H6J7 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C11orf49Q9H6J7 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C11orf49Q9H6J7 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C11orf49Q9H6J7 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C11orf49Q9H6J7 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C11orf49Q9H6J7 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
C11orf49Q9H6J7 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C11orf49Q9H6J7 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C11orf49Q9H6J7 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C11orf49Q9H6J7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C11orf49Q9H6J7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C11orf49Q9H6J7 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C11orf49Q9H6J7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C11orf49Q9H6J7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C11orf49Q9H6J7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C11orf49Q9H6J7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C11orf49Q9H6J7 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C11orf49Q9H6J7 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C11orf49Q9H6J7 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C11orf49Q9H6J7 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
C11orf49Q9H6J7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C11orf49Q9H6J7 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C11orf49Q9H6J7 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C11orf49Q9H6J7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C11orf49Q9H6J7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C11orf49Q9H6J7 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C11orf49Q9H6J7 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C11orf49Q9H6J7 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C11orf49Q9H6J7 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C11orf49Q9H6J7 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C11orf49Q9H6J7 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C11orf49Q9H6J7 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
C11orf49Q9H6J7 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C11orf49Q9H6J7 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
C11orf49Q9H6J7 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C11orf49Q9H6J7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C11orf49Q9H6J7 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C11orf49Q9H6J7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C11orf49Q9H6J7 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C11orf49Q9H6J7 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C11orf49Q9H6J7 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C11orf49Q9H6J7 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C11orf49Q9H6J7 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C11orf49Q9H6J7 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C11orf49Q9H6J7 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C11orf49Q9H6J7 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C11orf49Q9H6J7 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C11orf49Q9H6J7 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C11orf49Q9H6J7 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C11orf49Q9H6J7 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C11orf49Q9H6J7 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C11orf49Q9H6J7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C11orf49Q9H6J7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C11orf49Q9H6J7 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C11orf49Q9H6J7 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C11orf49Q9H6J7 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C11orf49Q9H6J7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
C11orf49Q9H6J7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C11orf49Q9H6J7 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C11orf49Q9H6J7 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C11orf49Q9H6J7 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C11orf49Q9H6J7 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C11orf49Q9H6J7 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C11orf49Q9H6J7 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C11orf49Q9H6J7 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C11orf49Q9H6J7 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C11orf49Q9H6J7 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C11orf49Q9H6J7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
C11orf49Q9H6J7 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms