Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.83
CLMPQ9H6B4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms