Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D5

NXF3, Nuclear RNA export factor 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF3Q9H4D5 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NXF3Q9H4D5 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NXF3Q9H4D5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NXF3Q9H4D5 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NXF3Q9H4D5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NXF3Q9H4D5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NXF3Q9H4D5 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NXF3Q9H4D5 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NXF3Q9H4D5 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NXF3Q9H4D5 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NXF3Q9H4D5 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NXF3Q9H4D5 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NXF3Q9H4D5 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NXF3Q9H4D5 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NXF3Q9H4D5 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NXF3Q9H4D5 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NXF3Q9H4D5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NXF3Q9H4D5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NXF3Q9H4D5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NXF3Q9H4D5 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NXF3Q9H4D5 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NXF3Q9H4D5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NXF3Q9H4D5 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NXF3Q9H4D5 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NXF3Q9H4D5 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NXF3Q9H4D5 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NXF3Q9H4D5 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NXF3Q9H4D5 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NXF3Q9H4D5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NXF3Q9H4D5 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NXF3Q9H4D5 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NXF3Q9H4D5 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NXF3Q9H4D5 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NXF3Q9H4D5 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NXF3Q9H4D5 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NXF3Q9H4D5 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NXF3Q9H4D5 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NXF3Q9H4D5 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NXF3Q9H4D5 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NXF3Q9H4D5 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NXF3Q9H4D5 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NXF3Q9H4D5 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NXF3Q9H4D5 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NXF3Q9H4D5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NXF3Q9H4D5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NXF3Q9H4D5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NXF3Q9H4D5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NXF3Q9H4D5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NXF3Q9H4D5 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NXF3Q9H4D5 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NXF3Q9H4D5 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NXF3Q9H4D5 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NXF3Q9H4D5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NXF3Q9H4D5 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NXF3Q9H4D5 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NXF3Q9H4D5 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NXF3Q9H4D5 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NXF3Q9H4D5 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NXF3Q9H4D5 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NXF3Q9H4D5 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NXF3Q9H4D5 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NXF3Q9H4D5 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NXF3Q9H4D5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NXF3Q9H4D5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NXF3Q9H4D5 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms