Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K3

ACTR3C, Actin-related protein 3C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3CQ9C0K3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTR3CQ9C0K3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTR3CQ9C0K3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTR3CQ9C0K3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTR3CQ9C0K3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTR3CQ9C0K3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTR3CQ9C0K3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTR3CQ9C0K3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTR3CQ9C0K3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTR3CQ9C0K3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTR3CQ9C0K3 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTR3CQ9C0K3 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTR3CQ9C0K3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTR3CQ9C0K3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTR3CQ9C0K3 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTR3CQ9C0K3 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTR3CQ9C0K3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTR3CQ9C0K3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTR3CQ9C0K3 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTR3CQ9C0K3 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTR3CQ9C0K3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTR3CQ9C0K3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTR3CQ9C0K3 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTR3CQ9C0K3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTR3CQ9C0K3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTR3CQ9C0K3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTR3CQ9C0K3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTR3CQ9C0K3 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTR3CQ9C0K3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTR3CQ9C0K3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTR3CQ9C0K3 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms