Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PHACTR1Q9C0D0 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PHACTR1Q9C0D0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PHACTR1Q9C0D0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PHACTR1Q9C0D0 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PHACTR1Q9C0D0 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHACTR1Q9C0D0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHACTR1Q9C0D0 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHACTR1Q9C0D0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHACTR1Q9C0D0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHACTR1Q9C0D0 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHACTR1Q9C0D0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHACTR1Q9C0D0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHACTR1Q9C0D0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHACTR1Q9C0D0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHACTR1Q9C0D0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHACTR1Q9C0D0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHACTR1Q9C0D0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHACTR1Q9C0D0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHACTR1Q9C0D0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHACTR1Q9C0D0 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHACTR1Q9C0D0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHACTR1Q9C0D0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHACTR1Q9C0D0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHACTR1Q9C0D0 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHACTR1Q9C0D0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHACTR1Q9C0D0 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHACTR1Q9C0D0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHACTR1Q9C0D0 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PHACTR1Q9C0D0 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHACTR1Q9C0D0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHACTR1Q9C0D0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHACTR1Q9C0D0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHACTR1Q9C0D0 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHACTR1Q9C0D0 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHACTR1Q9C0D0 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHACTR1Q9C0D0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHACTR1Q9C0D0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHACTR1Q9C0D0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHACTR1Q9C0D0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHACTR1Q9C0D0 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHACTR1Q9C0D0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHACTR1Q9C0D0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHACTR1Q9C0D0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHACTR1Q9C0D0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHACTR1Q9C0D0 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHACTR1Q9C0D0 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHACTR1Q9C0D0 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PHACTR1Q9C0D0 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHACTR1Q9C0D0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHACTR1Q9C0D0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHACTR1Q9C0D0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHACTR1Q9C0D0 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHACTR1Q9C0D0 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHACTR1Q9C0D0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHACTR1Q9C0D0 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHACTR1Q9C0D0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHACTR1Q9C0D0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHACTR1Q9C0D0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHACTR1Q9C0D0 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHACTR1Q9C0D0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHACTR1Q9C0D0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHACTR1Q9C0D0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHACTR1Q9C0D0 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHACTR1Q9C0D0 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHACTR1Q9C0D0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHACTR1Q9C0D0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHACTR1Q9C0D0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHACTR1Q9C0D0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHACTR1Q9C0D0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PHACTR1Q9C0D0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHACTR1Q9C0D0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHACTR1Q9C0D0 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHACTR1Q9C0D0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PHACTR1Q9C0D0 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHACTR1Q9C0D0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHACTR1Q9C0D0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHACTR1Q9C0D0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHACTR1Q9C0D0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHACTR1Q9C0D0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHACTR1Q9C0D0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHACTR1Q9C0D0 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHACTR1Q9C0D0 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHACTR1Q9C0D0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHACTR1Q9C0D0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHACTR1Q9C0D0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PHACTR1Q9C0D0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PHACTR1Q9C0D0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PHACTR1Q9C0D0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PHACTR1Q9C0D0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PHACTR1Q9C0D0 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PHACTR1Q9C0D0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PHACTR1Q9C0D0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PHACTR1Q9C0D0 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PHACTR1Q9C0D0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PHACTR1Q9C0D0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PHACTR1Q9C0D0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PHACTR1Q9C0D0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PHACTR1Q9C0D0 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PHACTR1Q9C0D0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms