Protein–RNA interactions for Protein: Q9C098

DCLK3, Serine/threonine-protein kinase DCLK3, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLK3Q9C098 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCLK3Q9C098 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCLK3Q9C098 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCLK3Q9C098 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCLK3Q9C098 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCLK3Q9C098 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCLK3Q9C098 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCLK3Q9C098 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCLK3Q9C098 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCLK3Q9C098 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCLK3Q9C098 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCLK3Q9C098 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCLK3Q9C098 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCLK3Q9C098 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCLK3Q9C098 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCLK3Q9C098 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCLK3Q9C098 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCLK3Q9C098 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DCLK3Q9C098 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCLK3Q9C098 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCLK3Q9C098 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCLK3Q9C098 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCLK3Q9C098 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCLK3Q9C098 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCLK3Q9C098 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DCLK3Q9C098 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCLK3Q9C098 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCLK3Q9C098 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
DCLK3Q9C098 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DCLK3Q9C098 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DCLK3Q9C098 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCLK3Q9C098 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DCLK3Q9C098 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DCLK3Q9C098 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCLK3Q9C098 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
DCLK3Q9C098 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCLK3Q9C098 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCLK3Q9C098 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCLK3Q9C098 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DCLK3Q9C098 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DCLK3Q9C098 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCLK3Q9C098 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCLK3Q9C098 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCLK3Q9C098 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms