Protein–RNA interactions for Protein: Q9C086

INO80B, INO80 complex subunit B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80BQ9C086 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
INO80BQ9C086 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
INO80BQ9C086 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
INO80BQ9C086 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
INO80BQ9C086 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
INO80BQ9C086 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
INO80BQ9C086 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
INO80BQ9C086 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
INO80BQ9C086 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
INO80BQ9C086 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
INO80BQ9C086 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
INO80BQ9C086 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
INO80BQ9C086 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
INO80BQ9C086 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
INO80BQ9C086 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
INO80BQ9C086 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
INO80BQ9C086 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
INO80BQ9C086 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
INO80BQ9C086 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
INO80BQ9C086 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
INO80BQ9C086 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
INO80BQ9C086 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
INO80BQ9C086 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
INO80BQ9C086 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
INO80BQ9C086 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
INO80BQ9C086 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
INO80BQ9C086 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
INO80BQ9C086 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
INO80BQ9C086 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
INO80BQ9C086 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
INO80BQ9C086 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
INO80BQ9C086 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
INO80BQ9C086 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
INO80BQ9C086 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
INO80BQ9C086 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
INO80BQ9C086 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
INO80BQ9C086 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
INO80BQ9C086 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
INO80BQ9C086 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
INO80BQ9C086 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
INO80BQ9C086 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
INO80BQ9C086 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
INO80BQ9C086 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
INO80BQ9C086 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
INO80BQ9C086 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
INO80BQ9C086 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
INO80BQ9C086 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
INO80BQ9C086 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
INO80BQ9C086 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
INO80BQ9C086 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
INO80BQ9C086 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
INO80BQ9C086 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
INO80BQ9C086 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
INO80BQ9C086 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
INO80BQ9C086 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
INO80BQ9C086 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
INO80BQ9C086 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
INO80BQ9C086 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
INO80BQ9C086 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
INO80BQ9C086 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
INO80BQ9C086 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
INO80BQ9C086 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
INO80BQ9C086 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
INO80BQ9C086 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
INO80BQ9C086 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
INO80BQ9C086 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
INO80BQ9C086 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
INO80BQ9C086 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
INO80BQ9C086 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
INO80BQ9C086 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
INO80BQ9C086 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
INO80BQ9C086 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
INO80BQ9C086 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
INO80BQ9C086 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
INO80BQ9C086 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
INO80BQ9C086 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
INO80BQ9C086 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
INO80BQ9C086 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
INO80BQ9C086 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
INO80BQ9C086 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
INO80BQ9C086 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
INO80BQ9C086 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
INO80BQ9C086 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
INO80BQ9C086 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
INO80BQ9C086 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
INO80BQ9C086 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
INO80BQ9C086 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms