Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZY9

TRIM31, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM31, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM31Q9BZY9 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms