Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZI7

UPF3B, Regulator of nonsense transcripts 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF3BQ9BZI7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UPF3BQ9BZI7 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UPF3BQ9BZI7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UPF3BQ9BZI7 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UPF3BQ9BZI7 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UPF3BQ9BZI7 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UPF3BQ9BZI7 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
UPF3BQ9BZI7 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UPF3BQ9BZI7 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UPF3BQ9BZI7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UPF3BQ9BZI7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UPF3BQ9BZI7 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UPF3BQ9BZI7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UPF3BQ9BZI7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UPF3BQ9BZI7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
UPF3BQ9BZI7 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
UPF3BQ9BZI7 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UPF3BQ9BZI7 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UPF3BQ9BZI7 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UPF3BQ9BZI7 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UPF3BQ9BZI7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UPF3BQ9BZI7 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UPF3BQ9BZI7 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UPF3BQ9BZI7 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
UPF3BQ9BZI7 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UPF3BQ9BZI7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UPF3BQ9BZI7 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
UPF3BQ9BZI7 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UPF3BQ9BZI7 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UPF3BQ9BZI7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UPF3BQ9BZI7 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UPF3BQ9BZI7 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UPF3BQ9BZI7 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UPF3BQ9BZI7 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UPF3BQ9BZI7 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UPF3BQ9BZI7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UPF3BQ9BZI7 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UPF3BQ9BZI7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
UPF3BQ9BZI7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UPF3BQ9BZI7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
UPF3BQ9BZI7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UPF3BQ9BZI7 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UPF3BQ9BZI7 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UPF3BQ9BZI7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UPF3BQ9BZI7 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UPF3BQ9BZI7 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UPF3BQ9BZI7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UPF3BQ9BZI7 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UPF3BQ9BZI7 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UPF3BQ9BZI7 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UPF3BQ9BZI7 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UPF3BQ9BZI7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UPF3BQ9BZI7 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UPF3BQ9BZI7 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UPF3BQ9BZI7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UPF3BQ9BZI7 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UPF3BQ9BZI7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UPF3BQ9BZI7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UPF3BQ9BZI7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UPF3BQ9BZI7 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UPF3BQ9BZI7 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UPF3BQ9BZI7 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UPF3BQ9BZI7 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UPF3BQ9BZI7 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UPF3BQ9BZI7 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UPF3BQ9BZI7 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UPF3BQ9BZI7 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UPF3BQ9BZI7 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UPF3BQ9BZI7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UPF3BQ9BZI7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UPF3BQ9BZI7 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UPF3BQ9BZI7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UPF3BQ9BZI7 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UPF3BQ9BZI7 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UPF3BQ9BZI7 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UPF3BQ9BZI7 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UPF3BQ9BZI7 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UPF3BQ9BZI7 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UPF3BQ9BZI7 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UPF3BQ9BZI7 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UPF3BQ9BZI7 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UPF3BQ9BZI7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UPF3BQ9BZI7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UPF3BQ9BZI7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UPF3BQ9BZI7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UPF3BQ9BZI7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UPF3BQ9BZI7 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UPF3BQ9BZI7 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UPF3BQ9BZI7 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UPF3BQ9BZI7 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UPF3BQ9BZI7 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UPF3BQ9BZI7 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UPF3BQ9BZI7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UPF3BQ9BZI7 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UPF3BQ9BZI7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UPF3BQ9BZI7 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UPF3BQ9BZI7 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UPF3BQ9BZI7 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UPF3BQ9BZI7 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UPF3BQ9BZI7 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms