Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PUS3Q9BZE2 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PUS3Q9BZE2 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PUS3Q9BZE2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PUS3Q9BZE2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PUS3Q9BZE2 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PUS3Q9BZE2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PUS3Q9BZE2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PUS3Q9BZE2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PUS3Q9BZE2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PUS3Q9BZE2 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PUS3Q9BZE2 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PUS3Q9BZE2 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PUS3Q9BZE2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PUS3Q9BZE2 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PUS3Q9BZE2 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PUS3Q9BZE2 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PUS3Q9BZE2 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PUS3Q9BZE2 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PUS3Q9BZE2 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PUS3Q9BZE2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PUS3Q9BZE2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PUS3Q9BZE2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PUS3Q9BZE2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PUS3Q9BZE2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PUS3Q9BZE2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PUS3Q9BZE2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PUS3Q9BZE2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PUS3Q9BZE2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PUS3Q9BZE2 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PUS3Q9BZE2 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PUS3Q9BZE2 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PUS3Q9BZE2 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PUS3Q9BZE2 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PUS3Q9BZE2 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PUS3Q9BZE2 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PUS3Q9BZE2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PUS3Q9BZE2 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PUS3Q9BZE2 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PUS3Q9BZE2 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PUS3Q9BZE2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PUS3Q9BZE2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PUS3Q9BZE2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PUS3Q9BZE2 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PUS3Q9BZE2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PUS3Q9BZE2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PUS3Q9BZE2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PUS3Q9BZE2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PUS3Q9BZE2 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PUS3Q9BZE2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PUS3Q9BZE2 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PUS3Q9BZE2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PUS3Q9BZE2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PUS3Q9BZE2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PUS3Q9BZE2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PUS3Q9BZE2 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PUS3Q9BZE2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PUS3Q9BZE2 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PUS3Q9BZE2 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PUS3Q9BZE2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PUS3Q9BZE2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PUS3Q9BZE2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PUS3Q9BZE2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PUS3Q9BZE2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PUS3Q9BZE2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PUS3Q9BZE2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PUS3Q9BZE2 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PUS3Q9BZE2 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PUS3Q9BZE2 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PUS3Q9BZE2 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PUS3Q9BZE2 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PUS3Q9BZE2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PUS3Q9BZE2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PUS3Q9BZE2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PUS3Q9BZE2 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PUS3Q9BZE2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PUS3Q9BZE2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PUS3Q9BZE2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PUS3Q9BZE2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PUS3Q9BZE2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PUS3Q9BZE2 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PUS3Q9BZE2 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PUS3Q9BZE2 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PUS3Q9BZE2 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PUS3Q9BZE2 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PUS3Q9BZE2 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PUS3Q9BZE2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PUS3Q9BZE2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PUS3Q9BZE2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PUS3Q9BZE2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PUS3Q9BZE2 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PUS3Q9BZE2 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PUS3Q9BZE2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PUS3Q9BZE2 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PUS3Q9BZE2 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PUS3Q9BZE2 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PUS3Q9BZE2 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PUS3Q9BZE2 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PUS3Q9BZE2 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PUS3Q9BZE2 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms