Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYU1

PBX4, Pre-B-cell leukemia transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX4Q9BYU1 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PBX4Q9BYU1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PBX4Q9BYU1 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PBX4Q9BYU1 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PBX4Q9BYU1 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PBX4Q9BYU1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PBX4Q9BYU1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PBX4Q9BYU1 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PBX4Q9BYU1 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PBX4Q9BYU1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PBX4Q9BYU1 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PBX4Q9BYU1 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PBX4Q9BYU1 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PBX4Q9BYU1 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PBX4Q9BYU1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PBX4Q9BYU1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PBX4Q9BYU1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PBX4Q9BYU1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PBX4Q9BYU1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PBX4Q9BYU1 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PBX4Q9BYU1 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PBX4Q9BYU1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PBX4Q9BYU1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PBX4Q9BYU1 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PBX4Q9BYU1 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PBX4Q9BYU1 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PBX4Q9BYU1 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PBX4Q9BYU1 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PBX4Q9BYU1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PBX4Q9BYU1 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PBX4Q9BYU1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PBX4Q9BYU1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PBX4Q9BYU1 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PBX4Q9BYU1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PBX4Q9BYU1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PBX4Q9BYU1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PBX4Q9BYU1 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PBX4Q9BYU1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PBX4Q9BYU1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PBX4Q9BYU1 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PBX4Q9BYU1 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PBX4Q9BYU1 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PBX4Q9BYU1 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PBX4Q9BYU1 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PBX4Q9BYU1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PBX4Q9BYU1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PBX4Q9BYU1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PBX4Q9BYU1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PBX4Q9BYU1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PBX4Q9BYU1 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PBX4Q9BYU1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PBX4Q9BYU1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PBX4Q9BYU1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PBX4Q9BYU1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PBX4Q9BYU1 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PBX4Q9BYU1 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PBX4Q9BYU1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PBX4Q9BYU1 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms