Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PCGF6Q9BYE7 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PCGF6Q9BYE7 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PCGF6Q9BYE7 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PCGF6Q9BYE7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PCGF6Q9BYE7 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PCGF6Q9BYE7 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PCGF6Q9BYE7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PCGF6Q9BYE7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PCGF6Q9BYE7 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PCGF6Q9BYE7 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PCGF6Q9BYE7 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PCGF6Q9BYE7 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PCGF6Q9BYE7 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PCGF6Q9BYE7 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PCGF6Q9BYE7 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PCGF6Q9BYE7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PCGF6Q9BYE7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PCGF6Q9BYE7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PCGF6Q9BYE7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
PCGF6Q9BYE7 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PCGF6Q9BYE7 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PCGF6Q9BYE7 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PCGF6Q9BYE7 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
PCGF6Q9BYE7 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
PCGF6Q9BYE7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PCGF6Q9BYE7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
PCGF6Q9BYE7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
PCGF6Q9BYE7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PCGF6Q9BYE7 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PCGF6Q9BYE7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PCGF6Q9BYE7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PCGF6Q9BYE7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PCGF6Q9BYE7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PCGF6Q9BYE7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PCGF6Q9BYE7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PCGF6Q9BYE7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PCGF6Q9BYE7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PCGF6Q9BYE7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PCGF6Q9BYE7 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PCGF6Q9BYE7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PCGF6Q9BYE7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PCGF6Q9BYE7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
PCGF6Q9BYE7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PCGF6Q9BYE7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PCGF6Q9BYE7 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PCGF6Q9BYE7 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PCGF6Q9BYE7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PCGF6Q9BYE7 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
PCGF6Q9BYE7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
PCGF6Q9BYE7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
PCGF6Q9BYE7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
PCGF6Q9BYE7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
PCGF6Q9BYE7 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
PCGF6Q9BYE7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
PCGF6Q9BYE7 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
PCGF6Q9BYE7 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
PCGF6Q9BYE7 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
PCGF6Q9BYE7 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PCGF6Q9BYE7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PCGF6Q9BYE7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PCGF6Q9BYE7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
PCGF6Q9BYE7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
PCGF6Q9BYE7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PCGF6Q9BYE7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PCGF6Q9BYE7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PCGF6Q9BYE7 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PCGF6Q9BYE7 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PCGF6Q9BYE7 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PCGF6Q9BYE7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PCGF6Q9BYE7 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PCGF6Q9BYE7 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PCGF6Q9BYE7 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PCGF6Q9BYE7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PCGF6Q9BYE7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PCGF6Q9BYE7 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PCGF6Q9BYE7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PCGF6Q9BYE7 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PCGF6Q9BYE7 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PCGF6Q9BYE7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PCGF6Q9BYE7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PCGF6Q9BYE7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PCGF6Q9BYE7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PCGF6Q9BYE7 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PCGF6Q9BYE7 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
PCGF6Q9BYE7 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PCGF6Q9BYE7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
PCGF6Q9BYE7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PCGF6Q9BYE7 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PCGF6Q9BYE7 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PCGF6Q9BYE7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PCGF6Q9BYE7 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PCGF6Q9BYE7 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PCGF6Q9BYE7 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PCGF6Q9BYE7 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
PCGF6Q9BYE7 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PCGF6Q9BYE7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PCGF6Q9BYE7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PCGF6Q9BYE7 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PCGF6Q9BYE7 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms