Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CACNG6Q9BXT2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNG6Q9BXT2 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNG6Q9BXT2 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNG6Q9BXT2 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNG6Q9BXT2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNG6Q9BXT2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNG6Q9BXT2 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNG6Q9BXT2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNG6Q9BXT2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNG6Q9BXT2 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNG6Q9BXT2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNG6Q9BXT2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNG6Q9BXT2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNG6Q9BXT2 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNG6Q9BXT2 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNG6Q9BXT2 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNG6Q9BXT2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms