Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms