Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVW6

SMIM2, Small integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM2Q9BVW6 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMIM2Q9BVW6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMIM2Q9BVW6 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMIM2Q9BVW6 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMIM2Q9BVW6 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMIM2Q9BVW6 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMIM2Q9BVW6 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM2Q9BVW6 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM2Q9BVW6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM2Q9BVW6 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM2Q9BVW6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM2Q9BVW6 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM2Q9BVW6 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM2Q9BVW6 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM2Q9BVW6 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM2Q9BVW6 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM2Q9BVW6 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM2Q9BVW6 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM2Q9BVW6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM2Q9BVW6 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM2Q9BVW6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM2Q9BVW6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM2Q9BVW6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM2Q9BVW6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM2Q9BVW6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM2Q9BVW6 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM2Q9BVW6 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM2Q9BVW6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM2Q9BVW6 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM2Q9BVW6 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM2Q9BVW6 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM2Q9BVW6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM2Q9BVW6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM2Q9BVW6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM2Q9BVW6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM2Q9BVW6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM2Q9BVW6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM2Q9BVW6 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM2Q9BVW6 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM2Q9BVW6 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM2Q9BVW6 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM2Q9BVW6 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM2Q9BVW6 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM2Q9BVW6 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM2Q9BVW6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM2Q9BVW6 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM2Q9BVW6 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM2Q9BVW6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM2Q9BVW6 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM2Q9BVW6 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM2Q9BVW6 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM2Q9BVW6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM2Q9BVW6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM2Q9BVW6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM2Q9BVW6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM2Q9BVW6 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM2Q9BVW6 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM2Q9BVW6 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM2Q9BVW6 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM2Q9BVW6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM2Q9BVW6 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMIM2Q9BVW6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMIM2Q9BVW6 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMIM2Q9BVW6 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMIM2Q9BVW6 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMIM2Q9BVW6 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMIM2Q9BVW6 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMIM2Q9BVW6 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMIM2Q9BVW6 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMIM2Q9BVW6 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMIM2Q9BVW6 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMIM2Q9BVW6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMIM2Q9BVW6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMIM2Q9BVW6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMIM2Q9BVW6 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMIM2Q9BVW6 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMIM2Q9BVW6 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMIM2Q9BVW6 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMIM2Q9BVW6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMIM2Q9BVW6 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMIM2Q9BVW6 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMIM2Q9BVW6 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMIM2Q9BVW6 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMIM2Q9BVW6 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMIM2Q9BVW6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMIM2Q9BVW6 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMIM2Q9BVW6 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMIM2Q9BVW6 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMIM2Q9BVW6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SMIM2Q9BVW6 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMIM2Q9BVW6 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMIM2Q9BVW6 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SMIM2Q9BVW6 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMIM2Q9BVW6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMIM2Q9BVW6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMIM2Q9BVW6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMIM2Q9BVW6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMIM2Q9BVW6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SMIM2Q9BVW6 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMIM2Q9BVW6 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms