Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT09

CNPY3, Protein canopy homolog 3, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPY3Q9BT09 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNPY3Q9BT09 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNPY3Q9BT09 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNPY3Q9BT09 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNPY3Q9BT09 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNPY3Q9BT09 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNPY3Q9BT09 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNPY3Q9BT09 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNPY3Q9BT09 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNPY3Q9BT09 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNPY3Q9BT09 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNPY3Q9BT09 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNPY3Q9BT09 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNPY3Q9BT09 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNPY3Q9BT09 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNPY3Q9BT09 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNPY3Q9BT09 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNPY3Q9BT09 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNPY3Q9BT09 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNPY3Q9BT09 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNPY3Q9BT09 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNPY3Q9BT09 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNPY3Q9BT09 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNPY3Q9BT09 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNPY3Q9BT09 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNPY3Q9BT09 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNPY3Q9BT09 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNPY3Q9BT09 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNPY3Q9BT09 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNPY3Q9BT09 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNPY3Q9BT09 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNPY3Q9BT09 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNPY3Q9BT09 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNPY3Q9BT09 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNPY3Q9BT09 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNPY3Q9BT09 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNPY3Q9BT09 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNPY3Q9BT09 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNPY3Q9BT09 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNPY3Q9BT09 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CNPY3Q9BT09 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNPY3Q9BT09 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNPY3Q9BT09 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CNPY3Q9BT09 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNPY3Q9BT09 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CNPY3Q9BT09 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNPY3Q9BT09 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNPY3Q9BT09 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNPY3Q9BT09 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNPY3Q9BT09 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNPY3Q9BT09 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNPY3Q9BT09 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNPY3Q9BT09 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNPY3Q9BT09 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNPY3Q9BT09 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNPY3Q9BT09 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNPY3Q9BT09 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNPY3Q9BT09 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNPY3Q9BT09 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CNPY3Q9BT09 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNPY3Q9BT09 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNPY3Q9BT09 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CNPY3Q9BT09 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNPY3Q9BT09 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNPY3Q9BT09 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNPY3Q9BT09 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNPY3Q9BT09 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNPY3Q9BT09 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNPY3Q9BT09 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNPY3Q9BT09 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNPY3Q9BT09 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CNPY3Q9BT09 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNPY3Q9BT09 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNPY3Q9BT09 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNPY3Q9BT09 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNPY3Q9BT09 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNPY3Q9BT09 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNPY3Q9BT09 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNPY3Q9BT09 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNPY3Q9BT09 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CNPY3Q9BT09 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNPY3Q9BT09 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNPY3Q9BT09 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNPY3Q9BT09 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNPY3Q9BT09 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNPY3Q9BT09 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNPY3Q9BT09 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNPY3Q9BT09 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNPY3Q9BT09 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNPY3Q9BT09 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNPY3Q9BT09 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNPY3Q9BT09 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNPY3Q9BT09 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNPY3Q9BT09 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNPY3Q9BT09 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CNPY3Q9BT09 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CNPY3Q9BT09 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNPY3Q9BT09 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNPY3Q9BT09 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNPY3Q9BT09 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
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