Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TIMM29Q9BSF4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TIMM29Q9BSF4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TIMM29Q9BSF4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TIMM29Q9BSF4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TIMM29Q9BSF4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TIMM29Q9BSF4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TIMM29Q9BSF4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TIMM29Q9BSF4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TIMM29Q9BSF4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TIMM29Q9BSF4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TIMM29Q9BSF4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TIMM29Q9BSF4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TIMM29Q9BSF4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TIMM29Q9BSF4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TIMM29Q9BSF4 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TIMM29Q9BSF4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TIMM29Q9BSF4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TIMM29Q9BSF4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TIMM29Q9BSF4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TIMM29Q9BSF4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TIMM29Q9BSF4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TIMM29Q9BSF4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TIMM29Q9BSF4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TIMM29Q9BSF4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TIMM29Q9BSF4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TIMM29Q9BSF4 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TIMM29Q9BSF4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TIMM29Q9BSF4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TIMM29Q9BSF4 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TIMM29Q9BSF4 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TIMM29Q9BSF4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TIMM29Q9BSF4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TIMM29Q9BSF4 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TIMM29Q9BSF4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TIMM29Q9BSF4 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TIMM29Q9BSF4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TIMM29Q9BSF4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TIMM29Q9BSF4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TIMM29Q9BSF4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TIMM29Q9BSF4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TIMM29Q9BSF4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TIMM29Q9BSF4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TIMM29Q9BSF4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TIMM29Q9BSF4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TIMM29Q9BSF4 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TIMM29Q9BSF4 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TIMM29Q9BSF4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TIMM29Q9BSF4 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TIMM29Q9BSF4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TIMM29Q9BSF4 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TIMM29Q9BSF4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TIMM29Q9BSF4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TIMM29Q9BSF4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TIMM29Q9BSF4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TIMM29Q9BSF4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TIMM29Q9BSF4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TIMM29Q9BSF4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TIMM29Q9BSF4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TIMM29Q9BSF4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TIMM29Q9BSF4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TIMM29Q9BSF4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TIMM29Q9BSF4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TIMM29Q9BSF4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TIMM29Q9BSF4 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TIMM29Q9BSF4 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TIMM29Q9BSF4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TIMM29Q9BSF4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TIMM29Q9BSF4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TIMM29Q9BSF4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TIMM29Q9BSF4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TIMM29Q9BSF4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TIMM29Q9BSF4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TIMM29Q9BSF4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TIMM29Q9BSF4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TIMM29Q9BSF4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TIMM29Q9BSF4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TIMM29Q9BSF4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TIMM29Q9BSF4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TIMM29Q9BSF4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TIMM29Q9BSF4 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TIMM29Q9BSF4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TIMM29Q9BSF4 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TIMM29Q9BSF4 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TIMM29Q9BSF4 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms