Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
FYCO1Q9BQS8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
FYCO1Q9BQS8 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
FYCO1Q9BQS8 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
FYCO1Q9BQS8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
FYCO1Q9BQS8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
FYCO1Q9BQS8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
FYCO1Q9BQS8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
FYCO1Q9BQS8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
FYCO1Q9BQS8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
FYCO1Q9BQS8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
FYCO1Q9BQS8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
FYCO1Q9BQS8 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
FYCO1Q9BQS8 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
FYCO1Q9BQS8 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
FYCO1Q9BQS8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
FYCO1Q9BQS8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
FYCO1Q9BQS8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
FYCO1Q9BQS8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
FYCO1Q9BQS8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
FYCO1Q9BQS8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
FYCO1Q9BQS8 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
FYCO1Q9BQS8 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
FYCO1Q9BQS8 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
FYCO1Q9BQS8 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
FYCO1Q9BQS8 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
FYCO1Q9BQS8 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
FYCO1Q9BQS8 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
FYCO1Q9BQS8 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
FYCO1Q9BQS8 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
FYCO1Q9BQS8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
FYCO1Q9BQS8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
FYCO1Q9BQS8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
FYCO1Q9BQS8 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
FYCO1Q9BQS8 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
FYCO1Q9BQS8 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
FYCO1Q9BQS8 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
FYCO1Q9BQS8 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
FYCO1Q9BQS8 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
FYCO1Q9BQS8 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC32.61■■■□□ 2.81
FYCO1Q9BQS8 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
FYCO1Q9BQS8 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
FYCO1Q9BQS8 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
FYCO1Q9BQS8 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
FYCO1Q9BQS8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
FYCO1Q9BQS8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
FYCO1Q9BQS8 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
FYCO1Q9BQS8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
FYCO1Q9BQS8 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
FYCO1Q9BQS8 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
FYCO1Q9BQS8 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
FYCO1Q9BQS8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
FYCO1Q9BQS8 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
FYCO1Q9BQS8 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
FYCO1Q9BQS8 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
FYCO1Q9BQS8 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
FYCO1Q9BQS8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
FYCO1Q9BQS8 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
FYCO1Q9BQS8 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
FYCO1Q9BQS8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
FYCO1Q9BQS8 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
FYCO1Q9BQS8 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
FYCO1Q9BQS8 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
FYCO1Q9BQS8 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
FYCO1Q9BQS8 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
FYCO1Q9BQS8 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
FYCO1Q9BQS8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
FYCO1Q9BQS8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
FYCO1Q9BQS8 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
FYCO1Q9BQS8 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
FYCO1Q9BQS8 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
FYCO1Q9BQS8 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
FYCO1Q9BQS8 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
FYCO1Q9BQS8 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
FYCO1Q9BQS8 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
FYCO1Q9BQS8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
FYCO1Q9BQS8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
FYCO1Q9BQS8 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
FYCO1Q9BQS8 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
FYCO1Q9BQS8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
FYCO1Q9BQS8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
FYCO1Q9BQS8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
FYCO1Q9BQS8 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
FYCO1Q9BQS8 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
FYCO1Q9BQS8 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
FYCO1Q9BQS8 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
FYCO1Q9BQS8 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
FYCO1Q9BQS8 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
FYCO1Q9BQS8 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
FYCO1Q9BQS8 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
FYCO1Q9BQS8 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
FYCO1Q9BQS8 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
FYCO1Q9BQS8 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC32.56■■■□□ 2.8
FYCO1Q9BQS8 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
FYCO1Q9BQS8 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
FYCO1Q9BQS8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
FYCO1Q9BQS8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
FYCO1Q9BQS8 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
FYCO1Q9BQS8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
FYCO1Q9BQS8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms