Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLF1Q9BQI6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLF1Q9BQI6 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SLF1Q9BQI6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLF1Q9BQI6 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLF1Q9BQI6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLF1Q9BQI6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLF1Q9BQI6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLF1Q9BQI6 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLF1Q9BQI6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLF1Q9BQI6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLF1Q9BQI6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLF1Q9BQI6 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLF1Q9BQI6 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLF1Q9BQI6 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLF1Q9BQI6 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLF1Q9BQI6 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SLF1Q9BQI6 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLF1Q9BQI6 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLF1Q9BQI6 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SLF1Q9BQI6 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLF1Q9BQI6 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLF1Q9BQI6 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLF1Q9BQI6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLF1Q9BQI6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLF1Q9BQI6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLF1Q9BQI6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLF1Q9BQI6 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLF1Q9BQI6 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLF1Q9BQI6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLF1Q9BQI6 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLF1Q9BQI6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLF1Q9BQI6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLF1Q9BQI6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SLF1Q9BQI6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLF1Q9BQI6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLF1Q9BQI6 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLF1Q9BQI6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLF1Q9BQI6 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLF1Q9BQI6 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLF1Q9BQI6 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLF1Q9BQI6 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLF1Q9BQI6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLF1Q9BQI6 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SLF1Q9BQI6 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLF1Q9BQI6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLF1Q9BQI6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLF1Q9BQI6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLF1Q9BQI6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SLF1Q9BQI6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLF1Q9BQI6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLF1Q9BQI6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLF1Q9BQI6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLF1Q9BQI6 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLF1Q9BQI6 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLF1Q9BQI6 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLF1Q9BQI6 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLF1Q9BQI6 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLF1Q9BQI6 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLF1Q9BQI6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLF1Q9BQI6 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLF1Q9BQI6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLF1Q9BQI6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLF1Q9BQI6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLF1Q9BQI6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLF1Q9BQI6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLF1Q9BQI6 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLF1Q9BQI6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLF1Q9BQI6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLF1Q9BQI6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLF1Q9BQI6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLF1Q9BQI6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLF1Q9BQI6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLF1Q9BQI6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLF1Q9BQI6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLF1Q9BQI6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLF1Q9BQI6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLF1Q9BQI6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLF1Q9BQI6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLF1Q9BQI6 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLF1Q9BQI6 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SLF1Q9BQI6 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLF1Q9BQI6 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLF1Q9BQI6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLF1Q9BQI6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLF1Q9BQI6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLF1Q9BQI6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLF1Q9BQI6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLF1Q9BQI6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLF1Q9BQI6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLF1Q9BQI6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLF1Q9BQI6 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SLF1Q9BQI6 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLF1Q9BQI6 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLF1Q9BQI6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLF1Q9BQI6 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLF1Q9BQI6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLF1Q9BQI6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLF1Q9BQI6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLF1Q9BQI6 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms