Protein–RNA interactions for Protein: Q99988

GDF15, Growth/differentiation factor 15, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF15Q99988 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDF15Q99988 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDF15Q99988 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDF15Q99988 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GDF15Q99988 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDF15Q99988 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDF15Q99988 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDF15Q99988 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDF15Q99988 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDF15Q99988 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDF15Q99988 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDF15Q99988 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDF15Q99988 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDF15Q99988 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDF15Q99988 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDF15Q99988 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDF15Q99988 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDF15Q99988 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDF15Q99988 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDF15Q99988 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF15Q99988 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF15Q99988 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF15Q99988 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF15Q99988 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF15Q99988 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF15Q99988 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF15Q99988 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF15Q99988 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF15Q99988 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF15Q99988 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF15Q99988 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF15Q99988 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF15Q99988 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF15Q99988 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF15Q99988 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF15Q99988 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF15Q99988 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF15Q99988 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF15Q99988 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF15Q99988 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDF15Q99988 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDF15Q99988 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDF15Q99988 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDF15Q99988 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDF15Q99988 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDF15Q99988 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDF15Q99988 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDF15Q99988 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDF15Q99988 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDF15Q99988 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDF15Q99988 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDF15Q99988 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDF15Q99988 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDF15Q99988 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDF15Q99988 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDF15Q99988 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDF15Q99988 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDF15Q99988 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDF15Q99988 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDF15Q99988 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDF15Q99988 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDF15Q99988 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDF15Q99988 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDF15Q99988 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDF15Q99988 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDF15Q99988 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDF15Q99988 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDF15Q99988 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDF15Q99988 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDF15Q99988 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDF15Q99988 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDF15Q99988 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDF15Q99988 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDF15Q99988 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDF15Q99988 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDF15Q99988 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GDF15Q99988 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDF15Q99988 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDF15Q99988 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDF15Q99988 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDF15Q99988 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDF15Q99988 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GDF15Q99988 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDF15Q99988 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDF15Q99988 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDF15Q99988 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDF15Q99988 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDF15Q99988 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDF15Q99988 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDF15Q99988 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDF15Q99988 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GDF15Q99988 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDF15Q99988 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDF15Q99988 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDF15Q99988 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDF15Q99988 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDF15Q99988 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDF15Q99988 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDF15Q99988 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDF15Q99988 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms