Protein–RNA interactions for Protein: Q99417

MYCBP, c-Myc-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCBPQ99417 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MYCBPQ99417 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms