Protein–RNA interactions for Protein: Q96TA2

YME1L1, ATP-dependent zinc metalloprotease YME1L1, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YME1L1Q96TA2 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
YME1L1Q96TA2 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
YME1L1Q96TA2 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
YME1L1Q96TA2 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
YME1L1Q96TA2 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
YME1L1Q96TA2 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
YME1L1Q96TA2 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
YME1L1Q96TA2 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
YME1L1Q96TA2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
YME1L1Q96TA2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
YME1L1Q96TA2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
YME1L1Q96TA2 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
YME1L1Q96TA2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
YME1L1Q96TA2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
YME1L1Q96TA2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
YME1L1Q96TA2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
YME1L1Q96TA2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
YME1L1Q96TA2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
YME1L1Q96TA2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
YME1L1Q96TA2 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
YME1L1Q96TA2 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
YME1L1Q96TA2 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
YME1L1Q96TA2 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
YME1L1Q96TA2 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
YME1L1Q96TA2 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
YME1L1Q96TA2 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
YME1L1Q96TA2 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
YME1L1Q96TA2 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
YME1L1Q96TA2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
YME1L1Q96TA2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
YME1L1Q96TA2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
YME1L1Q96TA2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms