Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS6

NUDCD1, NudC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD1Q96RS6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
NUDCD1Q96RS6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUDCD1Q96RS6 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms