Protein–RNA interactions for Protein: Q96RL1

UIMC1, BRCA1-A complex subunit RAP80, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UIMC1Q96RL1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UIMC1Q96RL1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UIMC1Q96RL1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UIMC1Q96RL1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UIMC1Q96RL1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UIMC1Q96RL1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UIMC1Q96RL1 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UIMC1Q96RL1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UIMC1Q96RL1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UIMC1Q96RL1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
UIMC1Q96RL1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UIMC1Q96RL1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UIMC1Q96RL1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UIMC1Q96RL1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UIMC1Q96RL1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
UIMC1Q96RL1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UIMC1Q96RL1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UIMC1Q96RL1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UIMC1Q96RL1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UIMC1Q96RL1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UIMC1Q96RL1 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UIMC1Q96RL1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UIMC1Q96RL1 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
UIMC1Q96RL1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
UIMC1Q96RL1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UIMC1Q96RL1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UIMC1Q96RL1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UIMC1Q96RL1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UIMC1Q96RL1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UIMC1Q96RL1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UIMC1Q96RL1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UIMC1Q96RL1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UIMC1Q96RL1 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UIMC1Q96RL1 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
UIMC1Q96RL1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
UIMC1Q96RL1 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UIMC1Q96RL1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UIMC1Q96RL1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UIMC1Q96RL1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UIMC1Q96RL1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UIMC1Q96RL1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UIMC1Q96RL1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UIMC1Q96RL1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UIMC1Q96RL1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UIMC1Q96RL1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
UIMC1Q96RL1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UIMC1Q96RL1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UIMC1Q96RL1 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UIMC1Q96RL1 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
UIMC1Q96RL1 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
UIMC1Q96RL1 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UIMC1Q96RL1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UIMC1Q96RL1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UIMC1Q96RL1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UIMC1Q96RL1 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UIMC1Q96RL1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UIMC1Q96RL1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UIMC1Q96RL1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UIMC1Q96RL1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UIMC1Q96RL1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UIMC1Q96RL1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UIMC1Q96RL1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UIMC1Q96RL1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UIMC1Q96RL1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UIMC1Q96RL1 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UIMC1Q96RL1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UIMC1Q96RL1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UIMC1Q96RL1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UIMC1Q96RL1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UIMC1Q96RL1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
UIMC1Q96RL1 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
UIMC1Q96RL1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
UIMC1Q96RL1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
UIMC1Q96RL1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UIMC1Q96RL1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UIMC1Q96RL1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UIMC1Q96RL1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
UIMC1Q96RL1 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UIMC1Q96RL1 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UIMC1Q96RL1 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UIMC1Q96RL1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UIMC1Q96RL1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UIMC1Q96RL1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UIMC1Q96RL1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UIMC1Q96RL1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
UIMC1Q96RL1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UIMC1Q96RL1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UIMC1Q96RL1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UIMC1Q96RL1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
UIMC1Q96RL1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
UIMC1Q96RL1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UIMC1Q96RL1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UIMC1Q96RL1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UIMC1Q96RL1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UIMC1Q96RL1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
UIMC1Q96RL1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UIMC1Q96RL1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UIMC1Q96RL1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UIMC1Q96RL1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UIMC1Q96RL1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms