Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW7

LRRC7, Leucine-rich repeat-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC7Q96NW7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LRRC7Q96NW7 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LRRC7Q96NW7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LRRC7Q96NW7 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
LRRC7Q96NW7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LRRC7Q96NW7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LRRC7Q96NW7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LRRC7Q96NW7 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LRRC7Q96NW7 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LRRC7Q96NW7 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LRRC7Q96NW7 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LRRC7Q96NW7 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LRRC7Q96NW7 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LRRC7Q96NW7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LRRC7Q96NW7 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LRRC7Q96NW7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LRRC7Q96NW7 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LRRC7Q96NW7 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LRRC7Q96NW7 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LRRC7Q96NW7 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LRRC7Q96NW7 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LRRC7Q96NW7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LRRC7Q96NW7 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LRRC7Q96NW7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LRRC7Q96NW7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LRRC7Q96NW7 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LRRC7Q96NW7 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LRRC7Q96NW7 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LRRC7Q96NW7 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LRRC7Q96NW7 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
LRRC7Q96NW7 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
LRRC7Q96NW7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LRRC7Q96NW7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LRRC7Q96NW7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LRRC7Q96NW7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
LRRC7Q96NW7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
LRRC7Q96NW7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
LRRC7Q96NW7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
LRRC7Q96NW7 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
LRRC7Q96NW7 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
LRRC7Q96NW7 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
LRRC7Q96NW7 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
LRRC7Q96NW7 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
LRRC7Q96NW7 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
LRRC7Q96NW7 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
LRRC7Q96NW7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
LRRC7Q96NW7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
LRRC7Q96NW7 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
LRRC7Q96NW7 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LRRC7Q96NW7 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
LRRC7Q96NW7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
LRRC7Q96NW7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LRRC7Q96NW7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
LRRC7Q96NW7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LRRC7Q96NW7 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LRRC7Q96NW7 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
LRRC7Q96NW7 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
LRRC7Q96NW7 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LRRC7Q96NW7 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LRRC7Q96NW7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LRRC7Q96NW7 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LRRC7Q96NW7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LRRC7Q96NW7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LRRC7Q96NW7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LRRC7Q96NW7 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LRRC7Q96NW7 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LRRC7Q96NW7 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LRRC7Q96NW7 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LRRC7Q96NW7 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LRRC7Q96NW7 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
LRRC7Q96NW7 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LRRC7Q96NW7 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LRRC7Q96NW7 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LRRC7Q96NW7 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LRRC7Q96NW7 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
LRRC7Q96NW7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LRRC7Q96NW7 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LRRC7Q96NW7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LRRC7Q96NW7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LRRC7Q96NW7 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LRRC7Q96NW7 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LRRC7Q96NW7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LRRC7Q96NW7 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LRRC7Q96NW7 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LRRC7Q96NW7 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LRRC7Q96NW7 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LRRC7Q96NW7 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LRRC7Q96NW7 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LRRC7Q96NW7 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LRRC7Q96NW7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LRRC7Q96NW7 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LRRC7Q96NW7 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LRRC7Q96NW7 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
LRRC7Q96NW7 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
LRRC7Q96NW7 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
LRRC7Q96NW7 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
LRRC7Q96NW7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LRRC7Q96NW7 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LRRC7Q96NW7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
LRRC7Q96NW7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms