Protein–RNA interactions for Protein: Q96MR6

CFAP57, Cilia- and flagella-associated protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP57Q96MR6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP57Q96MR6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP57Q96MR6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP57Q96MR6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP57Q96MR6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP57Q96MR6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP57Q96MR6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP57Q96MR6 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP57Q96MR6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP57Q96MR6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP57Q96MR6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP57Q96MR6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP57Q96MR6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CFAP57Q96MR6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CFAP57Q96MR6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP57Q96MR6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP57Q96MR6 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP57Q96MR6 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP57Q96MR6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP57Q96MR6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP57Q96MR6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP57Q96MR6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP57Q96MR6 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP57Q96MR6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP57Q96MR6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP57Q96MR6 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP57Q96MR6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP57Q96MR6 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP57Q96MR6 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP57Q96MR6 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP57Q96MR6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP57Q96MR6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP57Q96MR6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP57Q96MR6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP57Q96MR6 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP57Q96MR6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP57Q96MR6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP57Q96MR6 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP57Q96MR6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP57Q96MR6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP57Q96MR6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP57Q96MR6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP57Q96MR6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP57Q96MR6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP57Q96MR6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP57Q96MR6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP57Q96MR6 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP57Q96MR6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP57Q96MR6 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP57Q96MR6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP57Q96MR6 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP57Q96MR6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP57Q96MR6 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP57Q96MR6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP57Q96MR6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP57Q96MR6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP57Q96MR6 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP57Q96MR6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP57Q96MR6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP57Q96MR6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP57Q96MR6 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP57Q96MR6 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP57Q96MR6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP57Q96MR6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP57Q96MR6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP57Q96MR6 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP57Q96MR6 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP57Q96MR6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP57Q96MR6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP57Q96MR6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP57Q96MR6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP57Q96MR6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP57Q96MR6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP57Q96MR6 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP57Q96MR6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP57Q96MR6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP57Q96MR6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP57Q96MR6 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP57Q96MR6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP57Q96MR6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP57Q96MR6 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP57Q96MR6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP57Q96MR6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP57Q96MR6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP57Q96MR6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP57Q96MR6 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP57Q96MR6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP57Q96MR6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP57Q96MR6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP57Q96MR6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP57Q96MR6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP57Q96MR6 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP57Q96MR6 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP57Q96MR6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP57Q96MR6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP57Q96MR6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP57Q96MR6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP57Q96MR6 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP57Q96MR6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP57Q96MR6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms