Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG7

NSMCE3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE3Q96MG7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NSMCE3Q96MG7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NSMCE3Q96MG7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NSMCE3Q96MG7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NSMCE3Q96MG7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NSMCE3Q96MG7 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NSMCE3Q96MG7 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NSMCE3Q96MG7 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NSMCE3Q96MG7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NSMCE3Q96MG7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NSMCE3Q96MG7 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NSMCE3Q96MG7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NSMCE3Q96MG7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NSMCE3Q96MG7 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NSMCE3Q96MG7 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NSMCE3Q96MG7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NSMCE3Q96MG7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NSMCE3Q96MG7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NSMCE3Q96MG7 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NSMCE3Q96MG7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NSMCE3Q96MG7 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NSMCE3Q96MG7 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NSMCE3Q96MG7 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NSMCE3Q96MG7 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NSMCE3Q96MG7 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NSMCE3Q96MG7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NSMCE3Q96MG7 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NSMCE3Q96MG7 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NSMCE3Q96MG7 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NSMCE3Q96MG7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NSMCE3Q96MG7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NSMCE3Q96MG7 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NSMCE3Q96MG7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NSMCE3Q96MG7 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NSMCE3Q96MG7 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NSMCE3Q96MG7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NSMCE3Q96MG7 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NSMCE3Q96MG7 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NSMCE3Q96MG7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NSMCE3Q96MG7 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NSMCE3Q96MG7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NSMCE3Q96MG7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NSMCE3Q96MG7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NSMCE3Q96MG7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NSMCE3Q96MG7 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NSMCE3Q96MG7 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NSMCE3Q96MG7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NSMCE3Q96MG7 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NSMCE3Q96MG7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NSMCE3Q96MG7 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NSMCE3Q96MG7 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NSMCE3Q96MG7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NSMCE3Q96MG7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NSMCE3Q96MG7 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NSMCE3Q96MG7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NSMCE3Q96MG7 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NSMCE3Q96MG7 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NSMCE3Q96MG7 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NSMCE3Q96MG7 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NSMCE3Q96MG7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NSMCE3Q96MG7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NSMCE3Q96MG7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NSMCE3Q96MG7 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NSMCE3Q96MG7 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NSMCE3Q96MG7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NSMCE3Q96MG7 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NSMCE3Q96MG7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NSMCE3Q96MG7 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NSMCE3Q96MG7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NSMCE3Q96MG7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NSMCE3Q96MG7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NSMCE3Q96MG7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NSMCE3Q96MG7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NSMCE3Q96MG7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NSMCE3Q96MG7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NSMCE3Q96MG7 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NSMCE3Q96MG7 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NSMCE3Q96MG7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NSMCE3Q96MG7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NSMCE3Q96MG7 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NSMCE3Q96MG7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NSMCE3Q96MG7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NSMCE3Q96MG7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NSMCE3Q96MG7 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NSMCE3Q96MG7 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NSMCE3Q96MG7 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NSMCE3Q96MG7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NSMCE3Q96MG7 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NSMCE3Q96MG7 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NSMCE3Q96MG7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NSMCE3Q96MG7 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NSMCE3Q96MG7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NSMCE3Q96MG7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NSMCE3Q96MG7 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NSMCE3Q96MG7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NSMCE3Q96MG7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NSMCE3Q96MG7 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NSMCE3Q96MG7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NSMCE3Q96MG7 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NSMCE3Q96MG7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms