Protein–RNA interactions for Protein: Q96L92

SNX27, Sorting nexin-27, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX27Q96L92 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX27Q96L92 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX27Q96L92 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX27Q96L92 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX27Q96L92 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX27Q96L92 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX27Q96L92 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX27Q96L92 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX27Q96L92 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX27Q96L92 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX27Q96L92 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX27Q96L92 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX27Q96L92 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX27Q96L92 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX27Q96L92 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX27Q96L92 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX27Q96L92 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX27Q96L92 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX27Q96L92 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX27Q96L92 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX27Q96L92 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX27Q96L92 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX27Q96L92 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX27Q96L92 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX27Q96L92 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX27Q96L92 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX27Q96L92 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX27Q96L92 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX27Q96L92 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX27Q96L92 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX27Q96L92 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX27Q96L92 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX27Q96L92 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX27Q96L92 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX27Q96L92 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX27Q96L92 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX27Q96L92 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX27Q96L92 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX27Q96L92 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX27Q96L92 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX27Q96L92 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX27Q96L92 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX27Q96L92 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX27Q96L92 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX27Q96L92 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX27Q96L92 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX27Q96L92 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX27Q96L92 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX27Q96L92 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX27Q96L92 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX27Q96L92 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX27Q96L92 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX27Q96L92 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX27Q96L92 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX27Q96L92 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX27Q96L92 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX27Q96L92 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX27Q96L92 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX27Q96L92 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX27Q96L92 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX27Q96L92 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX27Q96L92 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX27Q96L92 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX27Q96L92 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX27Q96L92 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX27Q96L92 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX27Q96L92 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX27Q96L92 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX27Q96L92 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX27Q96L92 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX27Q96L92 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX27Q96L92 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX27Q96L92 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX27Q96L92 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX27Q96L92 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX27Q96L92 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX27Q96L92 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX27Q96L92 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX27Q96L92 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX27Q96L92 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX27Q96L92 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX27Q96L92 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX27Q96L92 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX27Q96L92 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX27Q96L92 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX27Q96L92 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX27Q96L92 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX27Q96L92 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX27Q96L92 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX27Q96L92 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX27Q96L92 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX27Q96L92 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX27Q96L92 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX27Q96L92 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX27Q96L92 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX27Q96L92 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX27Q96L92 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX27Q96L92 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX27Q96L92 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX27Q96L92 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms