Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP47Q96K76 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP47Q96K76 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP47Q96K76 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
USP47Q96K76 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP47Q96K76 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP47Q96K76 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP47Q96K76 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP47Q96K76 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP47Q96K76 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP47Q96K76 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP47Q96K76 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP47Q96K76 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP47Q96K76 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP47Q96K76 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
USP47Q96K76 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP47Q96K76 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP47Q96K76 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
USP47Q96K76 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP47Q96K76 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP47Q96K76 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
USP47Q96K76 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
USP47Q96K76 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
USP47Q96K76 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
USP47Q96K76 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
USP47Q96K76 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
USP47Q96K76 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
USP47Q96K76 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
USP47Q96K76 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
USP47Q96K76 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
USP47Q96K76 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
USP47Q96K76 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
USP47Q96K76 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
USP47Q96K76 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
USP47Q96K76 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
USP47Q96K76 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
USP47Q96K76 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
USP47Q96K76 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
USP47Q96K76 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
USP47Q96K76 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
USP47Q96K76 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
USP47Q96K76 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
USP47Q96K76 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
USP47Q96K76 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
USP47Q96K76 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
USP47Q96K76 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
USP47Q96K76 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
USP47Q96K76 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
USP47Q96K76 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
USP47Q96K76 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP47Q96K76 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP47Q96K76 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
USP47Q96K76 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP47Q96K76 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP47Q96K76 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP47Q96K76 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP47Q96K76 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP47Q96K76 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP47Q96K76 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
USP47Q96K76 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP47Q96K76 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP47Q96K76 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP47Q96K76 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
USP47Q96K76 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP47Q96K76 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP47Q96K76 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP47Q96K76 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP47Q96K76 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP47Q96K76 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP47Q96K76 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP47Q96K76 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP47Q96K76 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP47Q96K76 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP47Q96K76 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP47Q96K76 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP47Q96K76 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
USP47Q96K76 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP47Q96K76 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP47Q96K76 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP47Q96K76 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP47Q96K76 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP47Q96K76 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP47Q96K76 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP47Q96K76 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP47Q96K76 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
USP47Q96K76 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP47Q96K76 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP47Q96K76 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
USP47Q96K76 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
USP47Q96K76 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
USP47Q96K76 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
USP47Q96K76 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
USP47Q96K76 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.28
USP47Q96K76 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
USP47Q96K76 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
USP47Q96K76 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
USP47Q96K76 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
USP47Q96K76 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
USP47Q96K76 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
USP47Q96K76 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms