Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PGBD1Q96JS3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PGBD1Q96JS3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PGBD1Q96JS3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PGBD1Q96JS3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PGBD1Q96JS3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PGBD1Q96JS3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PGBD1Q96JS3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PGBD1Q96JS3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PGBD1Q96JS3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PGBD1Q96JS3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PGBD1Q96JS3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PGBD1Q96JS3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PGBD1Q96JS3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PGBD1Q96JS3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PGBD1Q96JS3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PGBD1Q96JS3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PGBD1Q96JS3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PGBD1Q96JS3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PGBD1Q96JS3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PGBD1Q96JS3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PGBD1Q96JS3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PGBD1Q96JS3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PGBD1Q96JS3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PGBD1Q96JS3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PGBD1Q96JS3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PGBD1Q96JS3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PGBD1Q96JS3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PGBD1Q96JS3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PGBD1Q96JS3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PGBD1Q96JS3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PGBD1Q96JS3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PGBD1Q96JS3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PGBD1Q96JS3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PGBD1Q96JS3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PGBD1Q96JS3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PGBD1Q96JS3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PGBD1Q96JS3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PGBD1Q96JS3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PGBD1Q96JS3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PGBD1Q96JS3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PGBD1Q96JS3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PGBD1Q96JS3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PGBD1Q96JS3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PGBD1Q96JS3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PGBD1Q96JS3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PGBD1Q96JS3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PGBD1Q96JS3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PGBD1Q96JS3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PGBD1Q96JS3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PGBD1Q96JS3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PGBD1Q96JS3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PGBD1Q96JS3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PGBD1Q96JS3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PGBD1Q96JS3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PGBD1Q96JS3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PGBD1Q96JS3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PGBD1Q96JS3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PGBD1Q96JS3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PGBD1Q96JS3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PGBD1Q96JS3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PGBD1Q96JS3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PGBD1Q96JS3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PGBD1Q96JS3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PGBD1Q96JS3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PGBD1Q96JS3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PGBD1Q96JS3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PGBD1Q96JS3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PGBD1Q96JS3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PGBD1Q96JS3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PGBD1Q96JS3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PGBD1Q96JS3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PGBD1Q96JS3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PGBD1Q96JS3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PGBD1Q96JS3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PGBD1Q96JS3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PGBD1Q96JS3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PGBD1Q96JS3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PGBD1Q96JS3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PGBD1Q96JS3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PGBD1Q96JS3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PGBD1Q96JS3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PGBD1Q96JS3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PGBD1Q96JS3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PGBD1Q96JS3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PGBD1Q96JS3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PGBD1Q96JS3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PGBD1Q96JS3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PGBD1Q96JS3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PGBD1Q96JS3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PGBD1Q96JS3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PGBD1Q96JS3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PGBD1Q96JS3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PGBD1Q96JS3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PGBD1Q96JS3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PGBD1Q96JS3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PGBD1Q96JS3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PGBD1Q96JS3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PGBD1Q96JS3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PGBD1Q96JS3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms