Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC136Q96JN2 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC136Q96JN2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC136Q96JN2 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC136Q96JN2 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC136Q96JN2 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC136Q96JN2 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC136Q96JN2 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC136Q96JN2 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC136Q96JN2 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC136Q96JN2 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC136Q96JN2 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC136Q96JN2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC136Q96JN2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC136Q96JN2 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC136Q96JN2 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC136Q96JN2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC136Q96JN2 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC136Q96JN2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC136Q96JN2 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC136Q96JN2 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC136Q96JN2 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC136Q96JN2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC136Q96JN2 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC136Q96JN2 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC136Q96JN2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC136Q96JN2 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC136Q96JN2 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC136Q96JN2 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC136Q96JN2 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC136Q96JN2 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC136Q96JN2 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC136Q96JN2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC136Q96JN2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC136Q96JN2 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC136Q96JN2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC136Q96JN2 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC136Q96JN2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC136Q96JN2 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC136Q96JN2 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC136Q96JN2 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC136Q96JN2 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC136Q96JN2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC136Q96JN2 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC136Q96JN2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC136Q96JN2 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC136Q96JN2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC136Q96JN2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC136Q96JN2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC136Q96JN2 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC136Q96JN2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC136Q96JN2 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC136Q96JN2 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC136Q96JN2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC136Q96JN2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC136Q96JN2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC136Q96JN2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC136Q96JN2 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC136Q96JN2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC136Q96JN2 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC136Q96JN2 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC136Q96JN2 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC136Q96JN2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC136Q96JN2 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC136Q96JN2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC136Q96JN2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC136Q96JN2 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC136Q96JN2 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC136Q96JN2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC136Q96JN2 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC136Q96JN2 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC136Q96JN2 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC136Q96JN2 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC136Q96JN2 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC136Q96JN2 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC136Q96JN2 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC136Q96JN2 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC136Q96JN2 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC136Q96JN2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC136Q96JN2 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC136Q96JN2 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC136Q96JN2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC136Q96JN2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC136Q96JN2 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC136Q96JN2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC136Q96JN2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC136Q96JN2 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC136Q96JN2 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC136Q96JN2 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC136Q96JN2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC136Q96JN2 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC136Q96JN2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms