Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
LRRIQ1Q96JM4 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
LRRIQ1Q96JM4 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC32.57■■■□□ 2.81
LRRIQ1Q96JM4 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.81
LRRIQ1Q96JM4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.81
LRRIQ1Q96JM4 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
LRRIQ1Q96JM4 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.81
LRRIQ1Q96JM4 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.81
LRRIQ1Q96JM4 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC32.57■■■□□ 2.81
LRRIQ1Q96JM4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
LRRIQ1Q96JM4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
LRRIQ1Q96JM4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
LRRIQ1Q96JM4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
LRRIQ1Q96JM4 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
LRRIQ1Q96JM4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
LRRIQ1Q96JM4 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
LRRIQ1Q96JM4 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
LRRIQ1Q96JM4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
LRRIQ1Q96JM4 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
LRRIQ1Q96JM4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
LRRIQ1Q96JM4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
LRRIQ1Q96JM4 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
LRRIQ1Q96JM4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
LRRIQ1Q96JM4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
LRRIQ1Q96JM4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
LRRIQ1Q96JM4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
LRRIQ1Q96JM4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
LRRIQ1Q96JM4 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
LRRIQ1Q96JM4 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
LRRIQ1Q96JM4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
LRRIQ1Q96JM4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
LRRIQ1Q96JM4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
LRRIQ1Q96JM4 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
LRRIQ1Q96JM4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
LRRIQ1Q96JM4 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
LRRIQ1Q96JM4 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
LRRIQ1Q96JM4 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
LRRIQ1Q96JM4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
LRRIQ1Q96JM4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
LRRIQ1Q96JM4 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
LRRIQ1Q96JM4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
LRRIQ1Q96JM4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
LRRIQ1Q96JM4 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
LRRIQ1Q96JM4 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
LRRIQ1Q96JM4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
LRRIQ1Q96JM4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
LRRIQ1Q96JM4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
LRRIQ1Q96JM4 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
LRRIQ1Q96JM4 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
LRRIQ1Q96JM4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
LRRIQ1Q96JM4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
LRRIQ1Q96JM4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
LRRIQ1Q96JM4 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
LRRIQ1Q96JM4 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
LRRIQ1Q96JM4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
LRRIQ1Q96JM4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
LRRIQ1Q96JM4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
LRRIQ1Q96JM4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
LRRIQ1Q96JM4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
LRRIQ1Q96JM4 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
LRRIQ1Q96JM4 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
LRRIQ1Q96JM4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
LRRIQ1Q96JM4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
LRRIQ1Q96JM4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
LRRIQ1Q96JM4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
LRRIQ1Q96JM4 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
LRRIQ1Q96JM4 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.8
LRRIQ1Q96JM4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC32.51■■■□□ 2.8
LRRIQ1Q96JM4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC32.51■■■□□ 2.8
LRRIQ1Q96JM4 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
LRRIQ1Q96JM4 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
LRRIQ1Q96JM4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
LRRIQ1Q96JM4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
LRRIQ1Q96JM4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
LRRIQ1Q96JM4 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
LRRIQ1Q96JM4 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
LRRIQ1Q96JM4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
LRRIQ1Q96JM4 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
LRRIQ1Q96JM4 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
LRRIQ1Q96JM4 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
LRRIQ1Q96JM4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
LRRIQ1Q96JM4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
LRRIQ1Q96JM4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
LRRIQ1Q96JM4 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
LRRIQ1Q96JM4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
LRRIQ1Q96JM4 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
LRRIQ1Q96JM4 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
LRRIQ1Q96JM4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
LRRIQ1Q96JM4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
LRRIQ1Q96JM4 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
LRRIQ1Q96JM4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
LRRIQ1Q96JM4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
LRRIQ1Q96JM4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
LRRIQ1Q96JM4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
LRRIQ1Q96JM4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
LRRIQ1Q96JM4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
LRRIQ1Q96JM4 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
LRRIQ1Q96JM4 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
LRRIQ1Q96JM4 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
LRRIQ1Q96JM4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
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