Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHAMP1Q96JM3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHAMP1Q96JM3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHAMP1Q96JM3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHAMP1Q96JM3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHAMP1Q96JM3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHAMP1Q96JM3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHAMP1Q96JM3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CHAMP1Q96JM3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHAMP1Q96JM3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHAMP1Q96JM3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHAMP1Q96JM3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CHAMP1Q96JM3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHAMP1Q96JM3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHAMP1Q96JM3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CHAMP1Q96JM3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHAMP1Q96JM3 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHAMP1Q96JM3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHAMP1Q96JM3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHAMP1Q96JM3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHAMP1Q96JM3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHAMP1Q96JM3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHAMP1Q96JM3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHAMP1Q96JM3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHAMP1Q96JM3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHAMP1Q96JM3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHAMP1Q96JM3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHAMP1Q96JM3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHAMP1Q96JM3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHAMP1Q96JM3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHAMP1Q96JM3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHAMP1Q96JM3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHAMP1Q96JM3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHAMP1Q96JM3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHAMP1Q96JM3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHAMP1Q96JM3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHAMP1Q96JM3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHAMP1Q96JM3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHAMP1Q96JM3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHAMP1Q96JM3 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHAMP1Q96JM3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHAMP1Q96JM3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHAMP1Q96JM3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHAMP1Q96JM3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHAMP1Q96JM3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms