Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
LRIG1Q96JA1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LRIG1Q96JA1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms