Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC34Q96HJ3 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC34Q96HJ3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC34Q96HJ3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC34Q96HJ3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC34Q96HJ3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC34Q96HJ3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC34Q96HJ3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC34Q96HJ3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC34Q96HJ3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC34Q96HJ3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC34Q96HJ3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC34Q96HJ3 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC34Q96HJ3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC34Q96HJ3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC34Q96HJ3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC34Q96HJ3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC34Q96HJ3 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC34Q96HJ3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC34Q96HJ3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC34Q96HJ3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC34Q96HJ3 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC34Q96HJ3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC34Q96HJ3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC34Q96HJ3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC34Q96HJ3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC34Q96HJ3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC34Q96HJ3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC34Q96HJ3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC34Q96HJ3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC34Q96HJ3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC34Q96HJ3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC34Q96HJ3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC34Q96HJ3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC34Q96HJ3 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC34Q96HJ3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC34Q96HJ3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC34Q96HJ3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC34Q96HJ3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC34Q96HJ3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC34Q96HJ3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC34Q96HJ3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC34Q96HJ3 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC34Q96HJ3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC34Q96HJ3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC34Q96HJ3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC34Q96HJ3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC34Q96HJ3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC34Q96HJ3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC34Q96HJ3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC34Q96HJ3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC34Q96HJ3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC34Q96HJ3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC34Q96HJ3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC34Q96HJ3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC34Q96HJ3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC34Q96HJ3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC34Q96HJ3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC34Q96HJ3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC34Q96HJ3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC34Q96HJ3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC34Q96HJ3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC34Q96HJ3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC34Q96HJ3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC34Q96HJ3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC34Q96HJ3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC34Q96HJ3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC34Q96HJ3 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC34Q96HJ3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC34Q96HJ3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC34Q96HJ3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC34Q96HJ3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC34Q96HJ3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC34Q96HJ3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC34Q96HJ3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC34Q96HJ3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC34Q96HJ3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC34Q96HJ3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC34Q96HJ3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC34Q96HJ3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC34Q96HJ3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC34Q96HJ3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC34Q96HJ3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC34Q96HJ3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC34Q96HJ3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC34Q96HJ3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC34Q96HJ3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC34Q96HJ3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC34Q96HJ3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC34Q96HJ3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC34Q96HJ3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC34Q96HJ3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC34Q96HJ3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC34Q96HJ3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC34Q96HJ3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC34Q96HJ3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC34Q96HJ3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC34Q96HJ3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms